Protein–RNA interactions for Protein: B2RUR8

Otud7b, OTU domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud7bB2RUR8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud7bB2RUR8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud7bB2RUR8 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms