Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms