Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R1

Gm2012, Predicted gene 2012, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2012B1B0R1 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2012B1B0R1 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2012B1B0R1 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2012B1B0R1 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2012B1B0R1 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2012B1B0R1 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2012B1B0R1 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2012B1B0R1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2012B1B0R1 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2012B1B0R1 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2012B1B0R1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2012B1B0R1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2012B1B0R1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2012B1B0R1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2012B1B0R1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2012B1B0R1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2012B1B0R1 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2012B1B0R1 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2012B1B0R1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2012B1B0R1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2012B1B0R1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2012B1B0R1 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2012B1B0R1 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2012B1B0R1 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2012B1B0R1 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2012B1B0R1 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm2012B1B0R1 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm2012B1B0R1 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm2012B1B0R1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm2012B1B0R1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm2012B1B0R1 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm2012B1B0R1 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2012B1B0R1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms