Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik3B1AS29 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms