Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M5A7VMS3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M5A7VMS3 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M5A7VMS3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M5A7VMS3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M5A7VMS3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M5A7VMS3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M5A7VMS3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M5A7VMS3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M5A7VMS3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M5A7VMS3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M5A7VMS3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M5A7VMS3 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M5A7VMS3 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M5A7VMS3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M5A7VMS3 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M5A7VMS3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M5A7VMS3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M5A7VMS3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M5A7VMS3 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M5A7VMS3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M5A7VMS3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M5A7VMS3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M5A7VMS3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M5A7VMS3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
H2-M5A7VMS3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
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H2-M5A7VMS3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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H2-M5A7VMS3 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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H2-M5A7VMS3 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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