Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbp4A4UUI3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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