Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ25

Skt, Sickle tail protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SktA2AQ25 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SktA2AQ25 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms