Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43bA2AM80 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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Fam43bA2AM80 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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Fam43bA2AM80 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Fam43bA2AM80 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Fam43bA2AM80 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Fam43bA2AM80 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Fam43bA2AM80 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam43bA2AM80 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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