Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Frmpd4A2AFR3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Frmpd4A2AFR3 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms