Protein–RNA interactions for Protein: A2A5X4

Krtap29-1, Keratin-associated protein 29-1, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap29-1A2A5X4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Krtap29-1A2A5X4 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms