Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
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