Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WRT9

Gm28490, Predicted gene 28490, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28490A0A087WRT9 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm28490A0A087WRT9 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm28490A0A087WRT9 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm28490A0A087WRT9 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28490A0A087WRT9 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28490A0A087WRT9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28490A0A087WRT9 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28490A0A087WRT9 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28490A0A087WRT9 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28490A0A087WRT9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28490A0A087WRT9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28490A0A087WRT9 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28490A0A087WRT9 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28490A0A087WRT9 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28490A0A087WRT9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28490A0A087WRT9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28490A0A087WRT9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28490A0A087WRT9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28490A0A087WRT9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28490A0A087WRT9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28490A0A087WRT9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms