Protein–RNA interactions for Protein: V9GXR0

H2-Bl, Histocompatibility 2, blastocyst, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-BlV9GXR0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2-BlV9GXR0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2-BlV9GXR0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2-BlV9GXR0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
H2-BlV9GXR0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2-BlV9GXR0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2-BlV9GXR0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2-BlV9GXR0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2-BlV9GXR0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-BlV9GXR0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-BlV9GXR0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-BlV9GXR0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-BlV9GXR0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-BlV9GXR0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-BlV9GXR0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-BlV9GXR0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-BlV9GXR0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-BlV9GXR0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2-BlV9GXR0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2-BlV9GXR0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2-BlV9GXR0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2-BlV9GXR0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2-BlV9GXR0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2-BlV9GXR0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2-BlV9GXR0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2-BlV9GXR0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2-BlV9GXR0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2-BlV9GXR0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2-BlV9GXR0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-BlV9GXR0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-BlV9GXR0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-BlV9GXR0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-BlV9GXR0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-BlV9GXR0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-BlV9GXR0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-BlV9GXR0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-BlV9GXR0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2-BlV9GXR0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2-BlV9GXR0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2-BlV9GXR0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2-BlV9GXR0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2-BlV9GXR0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-BlV9GXR0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-BlV9GXR0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-BlV9GXR0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-BlV9GXR0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-BlV9GXR0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-BlV9GXR0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-BlV9GXR0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-BlV9GXR0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-BlV9GXR0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-BlV9GXR0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
H2-BlV9GXR0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-BlV9GXR0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-BlV9GXR0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-BlV9GXR0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-BlV9GXR0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-BlV9GXR0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-BlV9GXR0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-BlV9GXR0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-BlV9GXR0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-BlV9GXR0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-BlV9GXR0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-BlV9GXR0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-BlV9GXR0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-BlV9GXR0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-BlV9GXR0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-BlV9GXR0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-BlV9GXR0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-BlV9GXR0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-BlV9GXR0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-BlV9GXR0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2-BlV9GXR0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2-BlV9GXR0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2-BlV9GXR0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-BlV9GXR0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-BlV9GXR0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-BlV9GXR0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-BlV9GXR0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-BlV9GXR0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-BlV9GXR0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-BlV9GXR0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-BlV9GXR0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-BlV9GXR0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
H2-BlV9GXR0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
H2-BlV9GXR0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-BlV9GXR0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-BlV9GXR0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-BlV9GXR0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-BlV9GXR0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-BlV9GXR0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-BlV9GXR0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-BlV9GXR0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-BlV9GXR0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-BlV9GXR0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-BlV9GXR0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-BlV9GXR0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-BlV9GXR0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-BlV9GXR0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-BlV9GXR0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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