Protein–RNA interactions for Protein: S4R2K0

Pdf, Peptide deformylase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdfS4R2K0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdfS4R2K0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdfS4R2K0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdfS4R2K0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdfS4R2K0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdfS4R2K0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdfS4R2K0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdfS4R2K0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdfS4R2K0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdfS4R2K0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdfS4R2K0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdfS4R2K0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdfS4R2K0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdfS4R2K0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdfS4R2K0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PdfS4R2K0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdfS4R2K0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdfS4R2K0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdfS4R2K0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdfS4R2K0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdfS4R2K0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdfS4R2K0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdfS4R2K0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdfS4R2K0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdfS4R2K0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdfS4R2K0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdfS4R2K0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdfS4R2K0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdfS4R2K0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdfS4R2K0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdfS4R2K0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdfS4R2K0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdfS4R2K0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdfS4R2K0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PdfS4R2K0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PdfS4R2K0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PdfS4R2K0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PdfS4R2K0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PdfS4R2K0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PdfS4R2K0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdfS4R2K0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PdfS4R2K0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdfS4R2K0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdfS4R2K0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdfS4R2K0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdfS4R2K0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdfS4R2K0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdfS4R2K0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdfS4R2K0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdfS4R2K0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdfS4R2K0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdfS4R2K0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdfS4R2K0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdfS4R2K0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdfS4R2K0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdfS4R2K0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdfS4R2K0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdfS4R2K0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdfS4R2K0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdfS4R2K0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdfS4R2K0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdfS4R2K0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdfS4R2K0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdfS4R2K0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdfS4R2K0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdfS4R2K0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdfS4R2K0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdfS4R2K0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdfS4R2K0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdfS4R2K0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdfS4R2K0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdfS4R2K0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdfS4R2K0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdfS4R2K0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdfS4R2K0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdfS4R2K0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdfS4R2K0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdfS4R2K0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdfS4R2K0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdfS4R2K0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdfS4R2K0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdfS4R2K0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdfS4R2K0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdfS4R2K0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdfS4R2K0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdfS4R2K0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdfS4R2K0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdfS4R2K0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdfS4R2K0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdfS4R2K0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdfS4R2K0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdfS4R2K0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PdfS4R2K0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdfS4R2K0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdfS4R2K0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdfS4R2K0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdfS4R2K0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdfS4R2K0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdfS4R2K0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PdfS4R2K0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms