Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W9

Gria3, Glutamate receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria3Q9Z2W9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gria3Q9Z2W9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gria3Q9Z2W9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gria3Q9Z2W9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gria3Q9Z2W9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gria3Q9Z2W9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gria3Q9Z2W9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gria3Q9Z2W9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gria3Q9Z2W9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gria3Q9Z2W9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gria3Q9Z2W9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gria3Q9Z2W9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gria3Q9Z2W9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gria3Q9Z2W9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gria3Q9Z2W9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gria3Q9Z2W9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gria3Q9Z2W9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gria3Q9Z2W9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gria3Q9Z2W9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gria3Q9Z2W9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gria3Q9Z2W9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gria3Q9Z2W9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gria3Q9Z2W9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gria3Q9Z2W9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gria3Q9Z2W9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gria3Q9Z2W9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gria3Q9Z2W9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gria3Q9Z2W9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gria3Q9Z2W9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gria3Q9Z2W9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gria3Q9Z2W9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gria3Q9Z2W9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gria3Q9Z2W9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gria3Q9Z2W9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gria3Q9Z2W9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gria3Q9Z2W9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gria3Q9Z2W9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gria3Q9Z2W9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gria3Q9Z2W9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gria3Q9Z2W9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gria3Q9Z2W9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gria3Q9Z2W9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gria3Q9Z2W9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gria3Q9Z2W9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gria3Q9Z2W9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gria3Q9Z2W9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gria3Q9Z2W9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gria3Q9Z2W9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gria3Q9Z2W9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gria3Q9Z2W9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gria3Q9Z2W9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gria3Q9Z2W9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gria3Q9Z2W9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gria3Q9Z2W9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gria3Q9Z2W9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gria3Q9Z2W9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gria3Q9Z2W9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gria3Q9Z2W9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gria3Q9Z2W9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gria3Q9Z2W9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gria3Q9Z2W9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gria3Q9Z2W9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gria3Q9Z2W9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gria3Q9Z2W9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gria3Q9Z2W9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gria3Q9Z2W9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gria3Q9Z2W9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gria3Q9Z2W9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gria3Q9Z2W9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gria3Q9Z2W9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gria3Q9Z2W9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gria3Q9Z2W9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gria3Q9Z2W9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gria3Q9Z2W9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gria3Q9Z2W9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gria3Q9Z2W9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gria3Q9Z2W9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gria3Q9Z2W9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gria3Q9Z2W9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gria3Q9Z2W9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gria3Q9Z2W9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gria3Q9Z2W9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gria3Q9Z2W9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gria3Q9Z2W9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gria3Q9Z2W9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gria3Q9Z2W9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gria3Q9Z2W9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gria3Q9Z2W9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gria3Q9Z2W9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gria3Q9Z2W9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gria3Q9Z2W9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gria3Q9Z2W9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gria3Q9Z2W9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gria3Q9Z2W9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gria3Q9Z2W9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gria3Q9Z2W9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gria3Q9Z2W9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gria3Q9Z2W9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gria3Q9Z2W9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gria3Q9Z2W9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms