Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E1

Mbd2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd2Q9Z2E1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mbd2Q9Z2E1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mbd2Q9Z2E1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mbd2Q9Z2E1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mbd2Q9Z2E1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mbd2Q9Z2E1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mbd2Q9Z2E1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mbd2Q9Z2E1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mbd2Q9Z2E1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Mbd2Q9Z2E1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mbd2Q9Z2E1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mbd2Q9Z2E1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mbd2Q9Z2E1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mbd2Q9Z2E1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mbd2Q9Z2E1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mbd2Q9Z2E1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mbd2Q9Z2E1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mbd2Q9Z2E1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mbd2Q9Z2E1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mbd2Q9Z2E1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mbd2Q9Z2E1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mbd2Q9Z2E1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mbd2Q9Z2E1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mbd2Q9Z2E1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mbd2Q9Z2E1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mbd2Q9Z2E1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mbd2Q9Z2E1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mbd2Q9Z2E1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mbd2Q9Z2E1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mbd2Q9Z2E1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mbd2Q9Z2E1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mbd2Q9Z2E1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Mbd2Q9Z2E1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Mbd2Q9Z2E1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Mbd2Q9Z2E1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Mbd2Q9Z2E1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mbd2Q9Z2E1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mbd2Q9Z2E1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mbd2Q9Z2E1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mbd2Q9Z2E1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mbd2Q9Z2E1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mbd2Q9Z2E1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mbd2Q9Z2E1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mbd2Q9Z2E1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mbd2Q9Z2E1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mbd2Q9Z2E1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mbd2Q9Z2E1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mbd2Q9Z2E1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mbd2Q9Z2E1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mbd2Q9Z2E1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mbd2Q9Z2E1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mbd2Q9Z2E1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mbd2Q9Z2E1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mbd2Q9Z2E1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mbd2Q9Z2E1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mbd2Q9Z2E1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mbd2Q9Z2E1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mbd2Q9Z2E1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mbd2Q9Z2E1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mbd2Q9Z2E1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mbd2Q9Z2E1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mbd2Q9Z2E1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mbd2Q9Z2E1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mbd2Q9Z2E1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mbd2Q9Z2E1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mbd2Q9Z2E1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mbd2Q9Z2E1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mbd2Q9Z2E1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mbd2Q9Z2E1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mbd2Q9Z2E1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mbd2Q9Z2E1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mbd2Q9Z2E1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mbd2Q9Z2E1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mbd2Q9Z2E1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mbd2Q9Z2E1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mbd2Q9Z2E1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mbd2Q9Z2E1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mbd2Q9Z2E1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd2Q9Z2E1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd2Q9Z2E1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd2Q9Z2E1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd2Q9Z2E1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd2Q9Z2E1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd2Q9Z2E1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mbd2Q9Z2E1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mbd2Q9Z2E1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mbd2Q9Z2E1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Mbd2Q9Z2E1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mbd2Q9Z2E1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mbd2Q9Z2E1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mbd2Q9Z2E1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd2Q9Z2E1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd2Q9Z2E1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd2Q9Z2E1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd2Q9Z2E1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd2Q9Z2E1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd2Q9Z2E1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd2Q9Z2E1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd2Q9Z2E1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mbd2Q9Z2E1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms