Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mbd4Q9Z2D7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mbd4Q9Z2D7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mbd4Q9Z2D7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mbd4Q9Z2D7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mbd4Q9Z2D7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mbd4Q9Z2D7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mbd4Q9Z2D7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mbd4Q9Z2D7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mbd4Q9Z2D7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mbd4Q9Z2D7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mbd4Q9Z2D7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mbd4Q9Z2D7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mbd4Q9Z2D7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mbd4Q9Z2D7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Mbd4Q9Z2D7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mbd4Q9Z2D7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mbd4Q9Z2D7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mbd4Q9Z2D7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mbd4Q9Z2D7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mbd4Q9Z2D7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mbd4Q9Z2D7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mbd4Q9Z2D7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mbd4Q9Z2D7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mbd4Q9Z2D7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mbd4Q9Z2D7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Mbd4Q9Z2D7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mbd4Q9Z2D7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mbd4Q9Z2D7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mbd4Q9Z2D7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mbd4Q9Z2D7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mbd4Q9Z2D7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mbd4Q9Z2D7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mbd4Q9Z2D7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mbd4Q9Z2D7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mbd4Q9Z2D7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mbd4Q9Z2D7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mbd4Q9Z2D7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mbd4Q9Z2D7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mbd4Q9Z2D7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mbd4Q9Z2D7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mbd4Q9Z2D7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mbd4Q9Z2D7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mbd4Q9Z2D7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mbd4Q9Z2D7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mbd4Q9Z2D7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mbd4Q9Z2D7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mbd4Q9Z2D7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mbd4Q9Z2D7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mbd4Q9Z2D7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mbd4Q9Z2D7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Mbd4Q9Z2D7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mbd4Q9Z2D7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mbd4Q9Z2D7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mbd4Q9Z2D7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mbd4Q9Z2D7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mbd4Q9Z2D7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mbd4Q9Z2D7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mbd4Q9Z2D7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mbd4Q9Z2D7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mbd4Q9Z2D7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Mbd4Q9Z2D7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mbd4Q9Z2D7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mbd4Q9Z2D7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mbd4Q9Z2D7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mbd4Q9Z2D7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mbd4Q9Z2D7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mbd4Q9Z2D7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mbd4Q9Z2D7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mbd4Q9Z2D7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mbd4Q9Z2D7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mbd4Q9Z2D7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mbd4Q9Z2D7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mbd4Q9Z2D7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mbd4Q9Z2D7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mbd4Q9Z2D7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mbd4Q9Z2D7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mbd4Q9Z2D7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mbd4Q9Z2D7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mbd4Q9Z2D7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mbd4Q9Z2D7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mbd4Q9Z2D7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mbd4Q9Z2D7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mbd4Q9Z2D7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mbd4Q9Z2D7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mbd4Q9Z2D7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mbd4Q9Z2D7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mbd4Q9Z2D7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mbd4Q9Z2D7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mbd4Q9Z2D7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mbd4Q9Z2D7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mbd4Q9Z2D7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mbd4Q9Z2D7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mbd4Q9Z2D7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mbd4Q9Z2D7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mbd4Q9Z2D7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Mbd4Q9Z2D7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mbd4Q9Z2D7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mbd4Q9Z2D7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mbd4Q9Z2D7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms