Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A5

Ate1, Arginyl-tRNA--protein transferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ate1Q9Z2A5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ate1Q9Z2A5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ate1Q9Z2A5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ate1Q9Z2A5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ate1Q9Z2A5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ate1Q9Z2A5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ate1Q9Z2A5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ate1Q9Z2A5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ate1Q9Z2A5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ate1Q9Z2A5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ate1Q9Z2A5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ate1Q9Z2A5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ate1Q9Z2A5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ate1Q9Z2A5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ate1Q9Z2A5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ate1Q9Z2A5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ate1Q9Z2A5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ate1Q9Z2A5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ate1Q9Z2A5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ate1Q9Z2A5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ate1Q9Z2A5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ate1Q9Z2A5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ate1Q9Z2A5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ate1Q9Z2A5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ate1Q9Z2A5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ate1Q9Z2A5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ate1Q9Z2A5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ate1Q9Z2A5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ate1Q9Z2A5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ate1Q9Z2A5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ate1Q9Z2A5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ate1Q9Z2A5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ate1Q9Z2A5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ate1Q9Z2A5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ate1Q9Z2A5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ate1Q9Z2A5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ate1Q9Z2A5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ate1Q9Z2A5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ate1Q9Z2A5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ate1Q9Z2A5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ate1Q9Z2A5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ate1Q9Z2A5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ate1Q9Z2A5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ate1Q9Z2A5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ate1Q9Z2A5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ate1Q9Z2A5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ate1Q9Z2A5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ate1Q9Z2A5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ate1Q9Z2A5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ate1Q9Z2A5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ate1Q9Z2A5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ate1Q9Z2A5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ate1Q9Z2A5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ate1Q9Z2A5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ate1Q9Z2A5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ate1Q9Z2A5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ate1Q9Z2A5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ate1Q9Z2A5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ate1Q9Z2A5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ate1Q9Z2A5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ate1Q9Z2A5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ate1Q9Z2A5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ate1Q9Z2A5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ate1Q9Z2A5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ate1Q9Z2A5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ate1Q9Z2A5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ate1Q9Z2A5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ate1Q9Z2A5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ate1Q9Z2A5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ate1Q9Z2A5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ate1Q9Z2A5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ate1Q9Z2A5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ate1Q9Z2A5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ate1Q9Z2A5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ate1Q9Z2A5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ate1Q9Z2A5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ate1Q9Z2A5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ate1Q9Z2A5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ate1Q9Z2A5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ate1Q9Z2A5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ate1Q9Z2A5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ate1Q9Z2A5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ate1Q9Z2A5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ate1Q9Z2A5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ate1Q9Z2A5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ate1Q9Z2A5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ate1Q9Z2A5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ate1Q9Z2A5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ate1Q9Z2A5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ate1Q9Z2A5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ate1Q9Z2A5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ate1Q9Z2A5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ate1Q9Z2A5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ate1Q9Z2A5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ate1Q9Z2A5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ate1Q9Z2A5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ate1Q9Z2A5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ate1Q9Z2A5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ate1Q9Z2A5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ate1Q9Z2A5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms