Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sfrp4Q9Z1N6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Sfrp4Q9Z1N6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfrp4Q9Z1N6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfrp4Q9Z1N6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfrp4Q9Z1N6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfrp4Q9Z1N6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfrp4Q9Z1N6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfrp4Q9Z1N6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfrp4Q9Z1N6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfrp4Q9Z1N6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfrp4Q9Z1N6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfrp4Q9Z1N6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfrp4Q9Z1N6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfrp4Q9Z1N6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfrp4Q9Z1N6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sfrp4Q9Z1N6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sfrp4Q9Z1N6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sfrp4Q9Z1N6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sfrp4Q9Z1N6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sfrp4Q9Z1N6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfrp4Q9Z1N6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfrp4Q9Z1N6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfrp4Q9Z1N6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfrp4Q9Z1N6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfrp4Q9Z1N6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfrp4Q9Z1N6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfrp4Q9Z1N6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfrp4Q9Z1N6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfrp4Q9Z1N6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfrp4Q9Z1N6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfrp4Q9Z1N6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfrp4Q9Z1N6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfrp4Q9Z1N6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfrp4Q9Z1N6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfrp4Q9Z1N6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfrp4Q9Z1N6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfrp4Q9Z1N6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sfrp4Q9Z1N6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sfrp4Q9Z1N6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sfrp4Q9Z1N6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sfrp4Q9Z1N6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sfrp4Q9Z1N6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sfrp4Q9Z1N6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sfrp4Q9Z1N6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sfrp4Q9Z1N6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sfrp4Q9Z1N6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sfrp4Q9Z1N6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sfrp4Q9Z1N6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sfrp4Q9Z1N6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfrp4Q9Z1N6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfrp4Q9Z1N6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfrp4Q9Z1N6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfrp4Q9Z1N6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfrp4Q9Z1N6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfrp4Q9Z1N6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfrp4Q9Z1N6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sfrp4Q9Z1N6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sfrp4Q9Z1N6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sfrp4Q9Z1N6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Sfrp4Q9Z1N6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sfrp4Q9Z1N6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sfrp4Q9Z1N6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfrp4Q9Z1N6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfrp4Q9Z1N6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfrp4Q9Z1N6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfrp4Q9Z1N6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfrp4Q9Z1N6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfrp4Q9Z1N6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sfrp4Q9Z1N6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sfrp4Q9Z1N6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sfrp4Q9Z1N6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sfrp4Q9Z1N6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sfrp4Q9Z1N6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sfrp4Q9Z1N6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sfrp4Q9Z1N6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sfrp4Q9Z1N6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sfrp4Q9Z1N6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sfrp4Q9Z1N6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sfrp4Q9Z1N6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sfrp4Q9Z1N6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sfrp4Q9Z1N6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sfrp4Q9Z1N6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sfrp4Q9Z1N6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sfrp4Q9Z1N6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sfrp4Q9Z1N6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sfrp4Q9Z1N6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sfrp4Q9Z1N6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sfrp4Q9Z1N6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sfrp4Q9Z1N6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sfrp4Q9Z1N6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sfrp4Q9Z1N6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sfrp4Q9Z1N6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sfrp4Q9Z1N6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sfrp4Q9Z1N6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sfrp4Q9Z1N6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sfrp4Q9Z1N6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sfrp4Q9Z1N6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms