Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Shcbp1Q9Z179 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Shcbp1Q9Z179 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Shcbp1Q9Z179 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shcbp1Q9Z179 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shcbp1Q9Z179 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shcbp1Q9Z179 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shcbp1Q9Z179 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shcbp1Q9Z179 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shcbp1Q9Z179 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shcbp1Q9Z179 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Shcbp1Q9Z179 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Shcbp1Q9Z179 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Shcbp1Q9Z179 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Shcbp1Q9Z179 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Shcbp1Q9Z179 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Shcbp1Q9Z179 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Shcbp1Q9Z179 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Shcbp1Q9Z179 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shcbp1Q9Z179 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shcbp1Q9Z179 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shcbp1Q9Z179 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shcbp1Q9Z179 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shcbp1Q9Z179 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Shcbp1Q9Z179 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Shcbp1Q9Z179 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Shcbp1Q9Z179 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Shcbp1Q9Z179 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Shcbp1Q9Z179 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Shcbp1Q9Z179 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Shcbp1Q9Z179 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Shcbp1Q9Z179 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Shcbp1Q9Z179 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shcbp1Q9Z179 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shcbp1Q9Z179 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Shcbp1Q9Z179 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Shcbp1Q9Z179 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shcbp1Q9Z179 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shcbp1Q9Z179 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shcbp1Q9Z179 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shcbp1Q9Z179 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Shcbp1Q9Z179 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shcbp1Q9Z179 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Shcbp1Q9Z179 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Shcbp1Q9Z179 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Shcbp1Q9Z179 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Shcbp1Q9Z179 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Shcbp1Q9Z179 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Shcbp1Q9Z179 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Shcbp1Q9Z179 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Shcbp1Q9Z179 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Shcbp1Q9Z179 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Shcbp1Q9Z179 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Shcbp1Q9Z179 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Shcbp1Q9Z179 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Shcbp1Q9Z179 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Shcbp1Q9Z179 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Shcbp1Q9Z179 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Shcbp1Q9Z179 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Shcbp1Q9Z179 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Shcbp1Q9Z179 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Shcbp1Q9Z179 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Shcbp1Q9Z179 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Shcbp1Q9Z179 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Shcbp1Q9Z179 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Shcbp1Q9Z179 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Shcbp1Q9Z179 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Shcbp1Q9Z179 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Shcbp1Q9Z179 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Shcbp1Q9Z179 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Shcbp1Q9Z179 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Shcbp1Q9Z179 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Shcbp1Q9Z179 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Shcbp1Q9Z179 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Shcbp1Q9Z179 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Shcbp1Q9Z179 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Shcbp1Q9Z179 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Shcbp1Q9Z179 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Shcbp1Q9Z179 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Shcbp1Q9Z179 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Shcbp1Q9Z179 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Shcbp1Q9Z179 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Shcbp1Q9Z179 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Shcbp1Q9Z179 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Shcbp1Q9Z179 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Shcbp1Q9Z179 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Shcbp1Q9Z179 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Shcbp1Q9Z179 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Shcbp1Q9Z179 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Shcbp1Q9Z179 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Shcbp1Q9Z179 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Shcbp1Q9Z179 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Shcbp1Q9Z179 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Shcbp1Q9Z179 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Shcbp1Q9Z179 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Shcbp1Q9Z179 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Shcbp1Q9Z179 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Shcbp1Q9Z179 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Shcbp1Q9Z179 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Shcbp1Q9Z179 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms