Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z175

Loxl3, Lysyl oxidase homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 754 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Loxl3Q9Z175 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Loxl3Q9Z175 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Loxl3Q9Z175 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Loxl3Q9Z175 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Loxl3Q9Z175 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Loxl3Q9Z175 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Loxl3Q9Z175 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Loxl3Q9Z175 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Loxl3Q9Z175 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Loxl3Q9Z175 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Loxl3Q9Z175 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Loxl3Q9Z175 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Loxl3Q9Z175 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Loxl3Q9Z175 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Loxl3Q9Z175 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Loxl3Q9Z175 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Loxl3Q9Z175 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Loxl3Q9Z175 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Loxl3Q9Z175 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Loxl3Q9Z175 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Loxl3Q9Z175 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Loxl3Q9Z175 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Loxl3Q9Z175 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Loxl3Q9Z175 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Loxl3Q9Z175 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Loxl3Q9Z175 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Loxl3Q9Z175 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Loxl3Q9Z175 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Loxl3Q9Z175 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Loxl3Q9Z175 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Loxl3Q9Z175 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Loxl3Q9Z175 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Loxl3Q9Z175 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Loxl3Q9Z175 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Loxl3Q9Z175 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Loxl3Q9Z175 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Loxl3Q9Z175 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Loxl3Q9Z175 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Loxl3Q9Z175 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Loxl3Q9Z175 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Loxl3Q9Z175 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Loxl3Q9Z175 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Loxl3Q9Z175 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Loxl3Q9Z175 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Loxl3Q9Z175 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Loxl3Q9Z175 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Loxl3Q9Z175 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Loxl3Q9Z175 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Loxl3Q9Z175 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Loxl3Q9Z175 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Loxl3Q9Z175 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Loxl3Q9Z175 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Loxl3Q9Z175 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Loxl3Q9Z175 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Loxl3Q9Z175 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Loxl3Q9Z175 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Loxl3Q9Z175 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Loxl3Q9Z175 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Loxl3Q9Z175 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Loxl3Q9Z175 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Loxl3Q9Z175 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Loxl3Q9Z175 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Loxl3Q9Z175 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Loxl3Q9Z175 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Loxl3Q9Z175 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Loxl3Q9Z175 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Loxl3Q9Z175 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Loxl3Q9Z175 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Loxl3Q9Z175 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Loxl3Q9Z175 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Loxl3Q9Z175 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Loxl3Q9Z175 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Loxl3Q9Z175 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Loxl3Q9Z175 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Loxl3Q9Z175 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Loxl3Q9Z175 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Loxl3Q9Z175 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Loxl3Q9Z175 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Loxl3Q9Z175 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Loxl3Q9Z175 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Loxl3Q9Z175 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Loxl3Q9Z175 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Loxl3Q9Z175 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Loxl3Q9Z175 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Loxl3Q9Z175 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Loxl3Q9Z175 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Loxl3Q9Z175 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Loxl3Q9Z175 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Loxl3Q9Z175 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Loxl3Q9Z175 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Loxl3Q9Z175 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Loxl3Q9Z175 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Loxl3Q9Z175 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Loxl3Q9Z175 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Loxl3Q9Z175 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Loxl3Q9Z175 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Loxl3Q9Z175 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Loxl3Q9Z175 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Loxl3Q9Z175 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Loxl3Q9Z175 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms