Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sumo3Q9Z172 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sumo3Q9Z172 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sumo3Q9Z172 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sumo3Q9Z172 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sumo3Q9Z172 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sumo3Q9Z172 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sumo3Q9Z172 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sumo3Q9Z172 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sumo3Q9Z172 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sumo3Q9Z172 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sumo3Q9Z172 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sumo3Q9Z172 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sumo3Q9Z172 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sumo3Q9Z172 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sumo3Q9Z172 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sumo3Q9Z172 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sumo3Q9Z172 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sumo3Q9Z172 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sumo3Q9Z172 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sumo3Q9Z172 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sumo3Q9Z172 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sumo3Q9Z172 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sumo3Q9Z172 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sumo3Q9Z172 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sumo3Q9Z172 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sumo3Q9Z172 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sumo3Q9Z172 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sumo3Q9Z172 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sumo3Q9Z172 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sumo3Q9Z172 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sumo3Q9Z172 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sumo3Q9Z172 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sumo3Q9Z172 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sumo3Q9Z172 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sumo3Q9Z172 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sumo3Q9Z172 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sumo3Q9Z172 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sumo3Q9Z172 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sumo3Q9Z172 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sumo3Q9Z172 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sumo3Q9Z172 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sumo3Q9Z172 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sumo3Q9Z172 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sumo3Q9Z172 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sumo3Q9Z172 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sumo3Q9Z172 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sumo3Q9Z172 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sumo3Q9Z172 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sumo3Q9Z172 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sumo3Q9Z172 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sumo3Q9Z172 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sumo3Q9Z172 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sumo3Q9Z172 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sumo3Q9Z172 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sumo3Q9Z172 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sumo3Q9Z172 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sumo3Q9Z172 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sumo3Q9Z172 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sumo3Q9Z172 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sumo3Q9Z172 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sumo3Q9Z172 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sumo3Q9Z172 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sumo3Q9Z172 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sumo3Q9Z172 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Sumo3Q9Z172 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sumo3Q9Z172 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sumo3Q9Z172 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sumo3Q9Z172 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sumo3Q9Z172 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sumo3Q9Z172 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sumo3Q9Z172 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sumo3Q9Z172 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sumo3Q9Z172 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sumo3Q9Z172 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sumo3Q9Z172 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sumo3Q9Z172 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sumo3Q9Z172 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sumo3Q9Z172 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sumo3Q9Z172 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sumo3Q9Z172 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sumo3Q9Z172 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sumo3Q9Z172 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sumo3Q9Z172 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sumo3Q9Z172 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sumo3Q9Z172 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sumo3Q9Z172 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sumo3Q9Z172 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sumo3Q9Z172 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sumo3Q9Z172 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sumo3Q9Z172 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sumo3Q9Z172 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sumo3Q9Z172 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sumo3Q9Z172 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sumo3Q9Z172 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sumo3Q9Z172 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sumo3Q9Z172 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sumo3Q9Z172 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sumo3Q9Z172 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sumo3Q9Z172 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms