Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z123

Sema4f, Semaphorin-4F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4fQ9Z123 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema4fQ9Z123 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema4fQ9Z123 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema4fQ9Z123 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema4fQ9Z123 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema4fQ9Z123 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema4fQ9Z123 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema4fQ9Z123 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema4fQ9Z123 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema4fQ9Z123 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema4fQ9Z123 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema4fQ9Z123 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema4fQ9Z123 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema4fQ9Z123 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema4fQ9Z123 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema4fQ9Z123 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema4fQ9Z123 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema4fQ9Z123 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema4fQ9Z123 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema4fQ9Z123 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema4fQ9Z123 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema4fQ9Z123 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema4fQ9Z123 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema4fQ9Z123 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema4fQ9Z123 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema4fQ9Z123 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema4fQ9Z123 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema4fQ9Z123 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema4fQ9Z123 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema4fQ9Z123 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema4fQ9Z123 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema4fQ9Z123 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema4fQ9Z123 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema4fQ9Z123 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema4fQ9Z123 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema4fQ9Z123 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema4fQ9Z123 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sema4fQ9Z123 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sema4fQ9Z123 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sema4fQ9Z123 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sema4fQ9Z123 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema4fQ9Z123 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema4fQ9Z123 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema4fQ9Z123 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sema4fQ9Z123 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sema4fQ9Z123 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sema4fQ9Z123 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sema4fQ9Z123 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sema4fQ9Z123 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sema4fQ9Z123 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sema4fQ9Z123 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sema4fQ9Z123 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sema4fQ9Z123 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sema4fQ9Z123 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema4fQ9Z123 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema4fQ9Z123 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema4fQ9Z123 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema4fQ9Z123 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema4fQ9Z123 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema4fQ9Z123 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema4fQ9Z123 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema4fQ9Z123 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sema4fQ9Z123 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema4fQ9Z123 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema4fQ9Z123 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema4fQ9Z123 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema4fQ9Z123 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema4fQ9Z123 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema4fQ9Z123 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema4fQ9Z123 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema4fQ9Z123 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema4fQ9Z123 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema4fQ9Z123 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema4fQ9Z123 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sema4fQ9Z123 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema4fQ9Z123 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema4fQ9Z123 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema4fQ9Z123 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema4fQ9Z123 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema4fQ9Z123 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema4fQ9Z123 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema4fQ9Z123 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sema4fQ9Z123 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema4fQ9Z123 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sema4fQ9Z123 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema4fQ9Z123 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema4fQ9Z123 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sema4fQ9Z123 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema4fQ9Z123 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema4fQ9Z123 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sema4fQ9Z123 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema4fQ9Z123 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema4fQ9Z123 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema4fQ9Z123 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema4fQ9Z123 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema4fQ9Z123 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sema4fQ9Z123 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema4fQ9Z123 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema4fQ9Z123 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sema4fQ9Z123 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms