Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z101

Pard6a, Partitioning defective 6 homolog alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6aQ9Z101 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pard6aQ9Z101 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pard6aQ9Z101 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pard6aQ9Z101 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pard6aQ9Z101 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pard6aQ9Z101 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pard6aQ9Z101 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pard6aQ9Z101 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pard6aQ9Z101 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pard6aQ9Z101 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pard6aQ9Z101 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Pard6aQ9Z101 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pard6aQ9Z101 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pard6aQ9Z101 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pard6aQ9Z101 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pard6aQ9Z101 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pard6aQ9Z101 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pard6aQ9Z101 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pard6aQ9Z101 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pard6aQ9Z101 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pard6aQ9Z101 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pard6aQ9Z101 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pard6aQ9Z101 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pard6aQ9Z101 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pard6aQ9Z101 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pard6aQ9Z101 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pard6aQ9Z101 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pard6aQ9Z101 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pard6aQ9Z101 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pard6aQ9Z101 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Pard6aQ9Z101 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pard6aQ9Z101 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pard6aQ9Z101 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pard6aQ9Z101 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pard6aQ9Z101 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pard6aQ9Z101 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pard6aQ9Z101 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pard6aQ9Z101 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pard6aQ9Z101 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pard6aQ9Z101 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pard6aQ9Z101 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pard6aQ9Z101 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pard6aQ9Z101 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pard6aQ9Z101 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pard6aQ9Z101 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pard6aQ9Z101 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pard6aQ9Z101 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pard6aQ9Z101 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pard6aQ9Z101 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pard6aQ9Z101 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pard6aQ9Z101 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pard6aQ9Z101 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pard6aQ9Z101 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pard6aQ9Z101 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pard6aQ9Z101 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pard6aQ9Z101 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pard6aQ9Z101 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pard6aQ9Z101 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pard6aQ9Z101 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pard6aQ9Z101 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pard6aQ9Z101 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pard6aQ9Z101 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pard6aQ9Z101 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pard6aQ9Z101 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pard6aQ9Z101 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pard6aQ9Z101 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pard6aQ9Z101 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pard6aQ9Z101 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pard6aQ9Z101 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pard6aQ9Z101 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pard6aQ9Z101 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pard6aQ9Z101 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pard6aQ9Z101 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pard6aQ9Z101 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pard6aQ9Z101 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pard6aQ9Z101 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pard6aQ9Z101 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pard6aQ9Z101 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pard6aQ9Z101 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pard6aQ9Z101 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pard6aQ9Z101 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pard6aQ9Z101 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pard6aQ9Z101 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Pard6aQ9Z101 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pard6aQ9Z101 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pard6aQ9Z101 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Pard6aQ9Z101 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pard6aQ9Z101 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pard6aQ9Z101 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pard6aQ9Z101 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pard6aQ9Z101 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pard6aQ9Z101 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pard6aQ9Z101 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pard6aQ9Z101 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pard6aQ9Z101 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pard6aQ9Z101 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pard6aQ9Z101 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pard6aQ9Z101 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pard6aQ9Z101 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pard6aQ9Z101 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms