Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL6

Extl3, Exostosin-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Extl3Q9WVL6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Extl3Q9WVL6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Extl3Q9WVL6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Extl3Q9WVL6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Extl3Q9WVL6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Extl3Q9WVL6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Extl3Q9WVL6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Extl3Q9WVL6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Extl3Q9WVL6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Extl3Q9WVL6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Extl3Q9WVL6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Extl3Q9WVL6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Extl3Q9WVL6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Extl3Q9WVL6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Extl3Q9WVL6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Extl3Q9WVL6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Extl3Q9WVL6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Extl3Q9WVL6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Extl3Q9WVL6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Extl3Q9WVL6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Extl3Q9WVL6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Extl3Q9WVL6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Extl3Q9WVL6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Extl3Q9WVL6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Extl3Q9WVL6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Extl3Q9WVL6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Extl3Q9WVL6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Extl3Q9WVL6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Extl3Q9WVL6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Extl3Q9WVL6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Extl3Q9WVL6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Extl3Q9WVL6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Extl3Q9WVL6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Extl3Q9WVL6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Extl3Q9WVL6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Extl3Q9WVL6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Extl3Q9WVL6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Extl3Q9WVL6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Extl3Q9WVL6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Extl3Q9WVL6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Extl3Q9WVL6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Extl3Q9WVL6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Extl3Q9WVL6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Extl3Q9WVL6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Extl3Q9WVL6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Extl3Q9WVL6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Extl3Q9WVL6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Extl3Q9WVL6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Extl3Q9WVL6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Extl3Q9WVL6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Extl3Q9WVL6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Extl3Q9WVL6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Extl3Q9WVL6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Extl3Q9WVL6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Extl3Q9WVL6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Extl3Q9WVL6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Extl3Q9WVL6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Extl3Q9WVL6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Extl3Q9WVL6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Extl3Q9WVL6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Extl3Q9WVL6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Extl3Q9WVL6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Extl3Q9WVL6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Extl3Q9WVL6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Extl3Q9WVL6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Extl3Q9WVL6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Extl3Q9WVL6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Extl3Q9WVL6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Extl3Q9WVL6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Extl3Q9WVL6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Extl3Q9WVL6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Extl3Q9WVL6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Extl3Q9WVL6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Extl3Q9WVL6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Extl3Q9WVL6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Extl3Q9WVL6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Extl3Q9WVL6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Extl3Q9WVL6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Extl3Q9WVL6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Extl3Q9WVL6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Extl3Q9WVL6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Extl3Q9WVL6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Extl3Q9WVL6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Extl3Q9WVL6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Extl3Q9WVL6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Extl3Q9WVL6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Extl3Q9WVL6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Extl3Q9WVL6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Extl3Q9WVL6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Extl3Q9WVL6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Extl3Q9WVL6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Extl3Q9WVL6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Extl3Q9WVL6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Extl3Q9WVL6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Extl3Q9WVL6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Extl3Q9WVL6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Extl3Q9WVL6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Extl3Q9WVL6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Extl3Q9WVL6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Extl3Q9WVL6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms