Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVF8

Tusc2, Tumor suppressor candidate 2, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tusc2Q9WVF8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tusc2Q9WVF8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tusc2Q9WVF8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tusc2Q9WVF8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tusc2Q9WVF8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tusc2Q9WVF8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tusc2Q9WVF8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tusc2Q9WVF8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tusc2Q9WVF8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tusc2Q9WVF8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tusc2Q9WVF8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tusc2Q9WVF8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tusc2Q9WVF8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tusc2Q9WVF8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tusc2Q9WVF8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tusc2Q9WVF8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tusc2Q9WVF8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tusc2Q9WVF8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tusc2Q9WVF8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tusc2Q9WVF8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tusc2Q9WVF8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tusc2Q9WVF8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tusc2Q9WVF8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tusc2Q9WVF8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tusc2Q9WVF8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tusc2Q9WVF8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tusc2Q9WVF8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tusc2Q9WVF8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tusc2Q9WVF8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tusc2Q9WVF8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tusc2Q9WVF8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tusc2Q9WVF8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tusc2Q9WVF8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tusc2Q9WVF8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tusc2Q9WVF8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tusc2Q9WVF8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tusc2Q9WVF8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tusc2Q9WVF8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tusc2Q9WVF8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tusc2Q9WVF8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tusc2Q9WVF8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tusc2Q9WVF8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tusc2Q9WVF8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tusc2Q9WVF8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tusc2Q9WVF8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tusc2Q9WVF8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tusc2Q9WVF8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tusc2Q9WVF8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tusc2Q9WVF8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tusc2Q9WVF8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tusc2Q9WVF8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tusc2Q9WVF8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tusc2Q9WVF8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tusc2Q9WVF8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tusc2Q9WVF8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tusc2Q9WVF8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tusc2Q9WVF8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tusc2Q9WVF8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tusc2Q9WVF8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tusc2Q9WVF8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tusc2Q9WVF8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tusc2Q9WVF8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tusc2Q9WVF8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tusc2Q9WVF8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tusc2Q9WVF8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tusc2Q9WVF8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tusc2Q9WVF8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tusc2Q9WVF8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tusc2Q9WVF8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tusc2Q9WVF8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tusc2Q9WVF8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tusc2Q9WVF8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tusc2Q9WVF8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tusc2Q9WVF8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tusc2Q9WVF8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tusc2Q9WVF8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tusc2Q9WVF8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tusc2Q9WVF8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tusc2Q9WVF8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tusc2Q9WVF8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tusc2Q9WVF8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tusc2Q9WVF8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tusc2Q9WVF8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tusc2Q9WVF8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tusc2Q9WVF8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tusc2Q9WVF8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tusc2Q9WVF8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tusc2Q9WVF8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tusc2Q9WVF8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tusc2Q9WVF8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tusc2Q9WVF8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tusc2Q9WVF8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tusc2Q9WVF8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tusc2Q9WVF8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tusc2Q9WVF8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tusc2Q9WVF8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tusc2Q9WVF8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tusc2Q9WVF8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tusc2Q9WVF8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tusc2Q9WVF8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms