Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV32

Arpc1b, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc1bQ9WV32 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arpc1bQ9WV32 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arpc1bQ9WV32 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arpc1bQ9WV32 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arpc1bQ9WV32 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arpc1bQ9WV32 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arpc1bQ9WV32 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arpc1bQ9WV32 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arpc1bQ9WV32 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arpc1bQ9WV32 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arpc1bQ9WV32 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arpc1bQ9WV32 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arpc1bQ9WV32 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arpc1bQ9WV32 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arpc1bQ9WV32 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arpc1bQ9WV32 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arpc1bQ9WV32 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arpc1bQ9WV32 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arpc1bQ9WV32 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arpc1bQ9WV32 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arpc1bQ9WV32 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arpc1bQ9WV32 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arpc1bQ9WV32 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arpc1bQ9WV32 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arpc1bQ9WV32 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arpc1bQ9WV32 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Arpc1bQ9WV32 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Arpc1bQ9WV32 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Arpc1bQ9WV32 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arpc1bQ9WV32 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arpc1bQ9WV32 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arpc1bQ9WV32 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Arpc1bQ9WV32 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arpc1bQ9WV32 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arpc1bQ9WV32 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arpc1bQ9WV32 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arpc1bQ9WV32 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arpc1bQ9WV32 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arpc1bQ9WV32 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Arpc1bQ9WV32 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arpc1bQ9WV32 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arpc1bQ9WV32 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arpc1bQ9WV32 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arpc1bQ9WV32 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arpc1bQ9WV32 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arpc1bQ9WV32 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arpc1bQ9WV32 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arpc1bQ9WV32 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arpc1bQ9WV32 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arpc1bQ9WV32 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arpc1bQ9WV32 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arpc1bQ9WV32 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arpc1bQ9WV32 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arpc1bQ9WV32 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arpc1bQ9WV32 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arpc1bQ9WV32 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arpc1bQ9WV32 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arpc1bQ9WV32 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arpc1bQ9WV32 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arpc1bQ9WV32 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arpc1bQ9WV32 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arpc1bQ9WV32 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arpc1bQ9WV32 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arpc1bQ9WV32 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arpc1bQ9WV32 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arpc1bQ9WV32 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Arpc1bQ9WV32 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Arpc1bQ9WV32 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Arpc1bQ9WV32 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Arpc1bQ9WV32 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arpc1bQ9WV32 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arpc1bQ9WV32 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arpc1bQ9WV32 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arpc1bQ9WV32 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arpc1bQ9WV32 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arpc1bQ9WV32 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arpc1bQ9WV32 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arpc1bQ9WV32 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arpc1bQ9WV32 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arpc1bQ9WV32 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arpc1bQ9WV32 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arpc1bQ9WV32 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arpc1bQ9WV32 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arpc1bQ9WV32 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arpc1bQ9WV32 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arpc1bQ9WV32 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arpc1bQ9WV32 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arpc1bQ9WV32 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arpc1bQ9WV32 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arpc1bQ9WV32 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Arpc1bQ9WV32 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arpc1bQ9WV32 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arpc1bQ9WV32 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arpc1bQ9WV32 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arpc1bQ9WV32 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arpc1bQ9WV32 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arpc1bQ9WV32 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arpc1bQ9WV32 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arpc1bQ9WV32 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arpc1bQ9WV32 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms