Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pfdn5Q9WU28 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pfdn5Q9WU28 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pfdn5Q9WU28 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pfdn5Q9WU28 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pfdn5Q9WU28 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pfdn5Q9WU28 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Pfdn5Q9WU28 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pfdn5Q9WU28 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pfdn5Q9WU28 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Pfdn5Q9WU28 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pfdn5Q9WU28 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pfdn5Q9WU28 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pfdn5Q9WU28 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pfdn5Q9WU28 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pfdn5Q9WU28 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pfdn5Q9WU28 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pfdn5Q9WU28 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pfdn5Q9WU28 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pfdn5Q9WU28 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pfdn5Q9WU28 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pfdn5Q9WU28 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pfdn5Q9WU28 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pfdn5Q9WU28 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pfdn5Q9WU28 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pfdn5Q9WU28 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pfdn5Q9WU28 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pfdn5Q9WU28 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pfdn5Q9WU28 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pfdn5Q9WU28 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pfdn5Q9WU28 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pfdn5Q9WU28 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pfdn5Q9WU28 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pfdn5Q9WU28 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pfdn5Q9WU28 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pfdn5Q9WU28 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pfdn5Q9WU28 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pfdn5Q9WU28 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pfdn5Q9WU28 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pfdn5Q9WU28 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pfdn5Q9WU28 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pfdn5Q9WU28 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pfdn5Q9WU28 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pfdn5Q9WU28 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pfdn5Q9WU28 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pfdn5Q9WU28 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pfdn5Q9WU28 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pfdn5Q9WU28 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pfdn5Q9WU28 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pfdn5Q9WU28 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pfdn5Q9WU28 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pfdn5Q9WU28 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pfdn5Q9WU28 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pfdn5Q9WU28 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pfdn5Q9WU28 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pfdn5Q9WU28 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pfdn5Q9WU28 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pfdn5Q9WU28 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pfdn5Q9WU28 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pfdn5Q9WU28 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pfdn5Q9WU28 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pfdn5Q9WU28 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pfdn5Q9WU28 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pfdn5Q9WU28 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pfdn5Q9WU28 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pfdn5Q9WU28 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pfdn5Q9WU28 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pfdn5Q9WU28 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pfdn5Q9WU28 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pfdn5Q9WU28 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pfdn5Q9WU28 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pfdn5Q9WU28 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pfdn5Q9WU28 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pfdn5Q9WU28 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pfdn5Q9WU28 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pfdn5Q9WU28 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pfdn5Q9WU28 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pfdn5Q9WU28 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pfdn5Q9WU28 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pfdn5Q9WU28 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pfdn5Q9WU28 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pfdn5Q9WU28 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pfdn5Q9WU28 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pfdn5Q9WU28 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pfdn5Q9WU28 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pfdn5Q9WU28 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pfdn5Q9WU28 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pfdn5Q9WU28 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pfdn5Q9WU28 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pfdn5Q9WU28 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pfdn5Q9WU28 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pfdn5Q9WU28 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pfdn5Q9WU28 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pfdn5Q9WU28 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pfdn5Q9WU28 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pfdn5Q9WU28 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pfdn5Q9WU28 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Pfdn5Q9WU28 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pfdn5Q9WU28 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pfdn5Q9WU28 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms