Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX5

Skp1, S-phase kinase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp1Q9WTX5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Skp1Q9WTX5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Skp1Q9WTX5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Skp1Q9WTX5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Skp1Q9WTX5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Skp1Q9WTX5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Skp1Q9WTX5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Skp1Q9WTX5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Skp1Q9WTX5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Skp1Q9WTX5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Skp1Q9WTX5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Skp1Q9WTX5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Skp1Q9WTX5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Skp1Q9WTX5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Skp1Q9WTX5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Skp1Q9WTX5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Skp1Q9WTX5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Skp1Q9WTX5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Skp1Q9WTX5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Skp1Q9WTX5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Skp1Q9WTX5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Skp1Q9WTX5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Skp1Q9WTX5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Skp1Q9WTX5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Skp1Q9WTX5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Skp1Q9WTX5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Skp1Q9WTX5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Skp1Q9WTX5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Skp1Q9WTX5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Skp1Q9WTX5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Skp1Q9WTX5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Skp1Q9WTX5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Skp1Q9WTX5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Skp1Q9WTX5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Skp1Q9WTX5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Skp1Q9WTX5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Skp1Q9WTX5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Skp1Q9WTX5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Skp1Q9WTX5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Skp1Q9WTX5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Skp1Q9WTX5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Skp1Q9WTX5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Skp1Q9WTX5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Skp1Q9WTX5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Skp1Q9WTX5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Skp1Q9WTX5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Skp1Q9WTX5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Skp1Q9WTX5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Skp1Q9WTX5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Skp1Q9WTX5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Skp1Q9WTX5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Skp1Q9WTX5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Skp1Q9WTX5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Skp1Q9WTX5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Skp1Q9WTX5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Skp1Q9WTX5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Skp1Q9WTX5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Skp1Q9WTX5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Skp1Q9WTX5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Skp1Q9WTX5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Skp1Q9WTX5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Skp1Q9WTX5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Skp1Q9WTX5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Skp1Q9WTX5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Skp1Q9WTX5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Skp1Q9WTX5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Skp1Q9WTX5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Skp1Q9WTX5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Skp1Q9WTX5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Skp1Q9WTX5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Skp1Q9WTX5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Skp1Q9WTX5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Skp1Q9WTX5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Skp1Q9WTX5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Skp1Q9WTX5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Skp1Q9WTX5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Skp1Q9WTX5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Skp1Q9WTX5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Skp1Q9WTX5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Skp1Q9WTX5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Skp1Q9WTX5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Skp1Q9WTX5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Skp1Q9WTX5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Skp1Q9WTX5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Skp1Q9WTX5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Skp1Q9WTX5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Skp1Q9WTX5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Skp1Q9WTX5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Skp1Q9WTX5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Skp1Q9WTX5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Skp1Q9WTX5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Skp1Q9WTX5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Skp1Q9WTX5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Skp1Q9WTX5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Skp1Q9WTX5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Skp1Q9WTX5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Skp1Q9WTX5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Skp1Q9WTX5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Skp1Q9WTX5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Skp1Q9WTX5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms