Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P3

Psmb2, Proteasome subunit beta type-2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb2Q9R1P3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmb2Q9R1P3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmb2Q9R1P3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psmb2Q9R1P3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb2Q9R1P3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb2Q9R1P3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb2Q9R1P3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb2Q9R1P3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb2Q9R1P3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb2Q9R1P3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb2Q9R1P3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb2Q9R1P3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb2Q9R1P3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb2Q9R1P3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb2Q9R1P3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb2Q9R1P3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb2Q9R1P3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb2Q9R1P3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb2Q9R1P3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb2Q9R1P3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb2Q9R1P3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb2Q9R1P3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb2Q9R1P3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb2Q9R1P3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb2Q9R1P3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb2Q9R1P3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb2Q9R1P3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb2Q9R1P3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb2Q9R1P3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb2Q9R1P3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb2Q9R1P3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb2Q9R1P3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb2Q9R1P3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb2Q9R1P3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb2Q9R1P3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb2Q9R1P3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb2Q9R1P3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb2Q9R1P3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb2Q9R1P3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb2Q9R1P3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb2Q9R1P3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb2Q9R1P3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb2Q9R1P3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb2Q9R1P3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb2Q9R1P3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb2Q9R1P3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb2Q9R1P3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb2Q9R1P3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb2Q9R1P3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb2Q9R1P3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb2Q9R1P3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb2Q9R1P3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb2Q9R1P3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb2Q9R1P3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb2Q9R1P3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb2Q9R1P3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb2Q9R1P3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb2Q9R1P3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb2Q9R1P3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb2Q9R1P3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb2Q9R1P3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb2Q9R1P3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb2Q9R1P3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb2Q9R1P3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb2Q9R1P3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb2Q9R1P3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb2Q9R1P3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb2Q9R1P3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb2Q9R1P3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb2Q9R1P3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb2Q9R1P3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb2Q9R1P3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb2Q9R1P3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb2Q9R1P3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb2Q9R1P3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb2Q9R1P3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb2Q9R1P3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb2Q9R1P3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb2Q9R1P3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb2Q9R1P3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb2Q9R1P3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb2Q9R1P3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb2Q9R1P3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb2Q9R1P3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Psmb2Q9R1P3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb2Q9R1P3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb2Q9R1P3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb2Q9R1P3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb2Q9R1P3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb2Q9R1P3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb2Q9R1P3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb2Q9R1P3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb2Q9R1P3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmb2Q9R1P3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmb2Q9R1P3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb2Q9R1P3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb2Q9R1P3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb2Q9R1P3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb2Q9R1P3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb2Q9R1P3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms