Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tubd1Q9R1K7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tubd1Q9R1K7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tubd1Q9R1K7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tubd1Q9R1K7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tubd1Q9R1K7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tubd1Q9R1K7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tubd1Q9R1K7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tubd1Q9R1K7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tubd1Q9R1K7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubd1Q9R1K7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tubd1Q9R1K7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tubd1Q9R1K7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tubd1Q9R1K7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tubd1Q9R1K7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubd1Q9R1K7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubd1Q9R1K7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubd1Q9R1K7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubd1Q9R1K7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubd1Q9R1K7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubd1Q9R1K7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubd1Q9R1K7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubd1Q9R1K7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubd1Q9R1K7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubd1Q9R1K7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubd1Q9R1K7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubd1Q9R1K7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubd1Q9R1K7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubd1Q9R1K7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tubd1Q9R1K7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tubd1Q9R1K7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tubd1Q9R1K7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubd1Q9R1K7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubd1Q9R1K7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubd1Q9R1K7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubd1Q9R1K7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubd1Q9R1K7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubd1Q9R1K7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubd1Q9R1K7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubd1Q9R1K7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tubd1Q9R1K7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tubd1Q9R1K7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tubd1Q9R1K7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tubd1Q9R1K7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubd1Q9R1K7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubd1Q9R1K7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubd1Q9R1K7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubd1Q9R1K7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubd1Q9R1K7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubd1Q9R1K7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubd1Q9R1K7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubd1Q9R1K7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubd1Q9R1K7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubd1Q9R1K7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubd1Q9R1K7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubd1Q9R1K7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubd1Q9R1K7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubd1Q9R1K7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubd1Q9R1K7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubd1Q9R1K7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubd1Q9R1K7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubd1Q9R1K7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubd1Q9R1K7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubd1Q9R1K7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubd1Q9R1K7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubd1Q9R1K7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubd1Q9R1K7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubd1Q9R1K7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tubd1Q9R1K7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tubd1Q9R1K7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tubd1Q9R1K7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tubd1Q9R1K7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tubd1Q9R1K7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tubd1Q9R1K7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubd1Q9R1K7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubd1Q9R1K7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubd1Q9R1K7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubd1Q9R1K7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubd1Q9R1K7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubd1Q9R1K7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubd1Q9R1K7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubd1Q9R1K7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubd1Q9R1K7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubd1Q9R1K7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubd1Q9R1K7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubd1Q9R1K7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubd1Q9R1K7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubd1Q9R1K7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubd1Q9R1K7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubd1Q9R1K7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubd1Q9R1K7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubd1Q9R1K7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubd1Q9R1K7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubd1Q9R1K7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubd1Q9R1K7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubd1Q9R1K7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubd1Q9R1K7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubd1Q9R1K7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubd1Q9R1K7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubd1Q9R1K7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms