Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trex2Q9R1A9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trex2Q9R1A9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trex2Q9R1A9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trex2Q9R1A9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trex2Q9R1A9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trex2Q9R1A9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trex2Q9R1A9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trex2Q9R1A9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trex2Q9R1A9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trex2Q9R1A9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trex2Q9R1A9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trex2Q9R1A9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trex2Q9R1A9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trex2Q9R1A9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trex2Q9R1A9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trex2Q9R1A9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trex2Q9R1A9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trex2Q9R1A9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trex2Q9R1A9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trex2Q9R1A9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trex2Q9R1A9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trex2Q9R1A9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trex2Q9R1A9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trex2Q9R1A9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trex2Q9R1A9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trex2Q9R1A9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trex2Q9R1A9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trex2Q9R1A9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trex2Q9R1A9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trex2Q9R1A9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trex2Q9R1A9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trex2Q9R1A9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trex2Q9R1A9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trex2Q9R1A9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trex2Q9R1A9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trex2Q9R1A9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trex2Q9R1A9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trex2Q9R1A9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trex2Q9R1A9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trex2Q9R1A9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trex2Q9R1A9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trex2Q9R1A9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trex2Q9R1A9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trex2Q9R1A9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trex2Q9R1A9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trex2Q9R1A9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trex2Q9R1A9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trex2Q9R1A9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trex2Q9R1A9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trex2Q9R1A9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trex2Q9R1A9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trex2Q9R1A9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trex2Q9R1A9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trex2Q9R1A9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trex2Q9R1A9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trex2Q9R1A9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Trex2Q9R1A9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trex2Q9R1A9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trex2Q9R1A9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trex2Q9R1A9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trex2Q9R1A9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trex2Q9R1A9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trex2Q9R1A9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trex2Q9R1A9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trex2Q9R1A9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trex2Q9R1A9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Trex2Q9R1A9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trex2Q9R1A9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trex2Q9R1A9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trex2Q9R1A9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Trex2Q9R1A9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trex2Q9R1A9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trex2Q9R1A9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trex2Q9R1A9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trex2Q9R1A9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trex2Q9R1A9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trex2Q9R1A9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Trex2Q9R1A9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trex2Q9R1A9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trex2Q9R1A9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trex2Q9R1A9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trex2Q9R1A9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trex2Q9R1A9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trex2Q9R1A9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trex2Q9R1A9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trex2Q9R1A9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trex2Q9R1A9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trex2Q9R1A9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trex2Q9R1A9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trex2Q9R1A9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trex2Q9R1A9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trex2Q9R1A9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trex2Q9R1A9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trex2Q9R1A9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trex2Q9R1A9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trex2Q9R1A9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trex2Q9R1A9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trex2Q9R1A9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trex2Q9R1A9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms