Protein–RNA interactions for Protein: Q9R194

Cry2, Cryptochrome-2, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry2Q9R194 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cry2Q9R194 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cry2Q9R194 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cry2Q9R194 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cry2Q9R194 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cry2Q9R194 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cry2Q9R194 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cry2Q9R194 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cry2Q9R194 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cry2Q9R194 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cry2Q9R194 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cry2Q9R194 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cry2Q9R194 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cry2Q9R194 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cry2Q9R194 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cry2Q9R194 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cry2Q9R194 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cry2Q9R194 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cry2Q9R194 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Cry2Q9R194 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cry2Q9R194 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Cry2Q9R194 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cry2Q9R194 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cry2Q9R194 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cry2Q9R194 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cry2Q9R194 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cry2Q9R194 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cry2Q9R194 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cry2Q9R194 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cry2Q9R194 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cry2Q9R194 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cry2Q9R194 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cry2Q9R194 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cry2Q9R194 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Cry2Q9R194 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cry2Q9R194 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cry2Q9R194 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cry2Q9R194 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cry2Q9R194 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cry2Q9R194 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cry2Q9R194 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cry2Q9R194 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cry2Q9R194 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cry2Q9R194 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cry2Q9R194 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cry2Q9R194 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cry2Q9R194 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Cry2Q9R194 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Cry2Q9R194 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cry2Q9R194 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cry2Q9R194 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cry2Q9R194 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cry2Q9R194 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cry2Q9R194 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cry2Q9R194 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cry2Q9R194 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cry2Q9R194 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Cry2Q9R194 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cry2Q9R194 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cry2Q9R194 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cry2Q9R194 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cry2Q9R194 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cry2Q9R194 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cry2Q9R194 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cry2Q9R194 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cry2Q9R194 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cry2Q9R194 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cry2Q9R194 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cry2Q9R194 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cry2Q9R194 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cry2Q9R194 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cry2Q9R194 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cry2Q9R194 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cry2Q9R194 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cry2Q9R194 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cry2Q9R194 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cry2Q9R194 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cry2Q9R194 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cry2Q9R194 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cry2Q9R194 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cry2Q9R194 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cry2Q9R194 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cry2Q9R194 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cry2Q9R194 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cry2Q9R194 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cry2Q9R194 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cry2Q9R194 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cry2Q9R194 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cry2Q9R194 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cry2Q9R194 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cry2Q9R194 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cry2Q9R194 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Cry2Q9R194 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cry2Q9R194 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cry2Q9R194 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cry2Q9R194 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cry2Q9R194 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cry2Q9R194 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cry2Q9R194 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cry2Q9R194 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms