Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L9

Cd164, Sialomucin core protein 24, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd164Q9R0L9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cd164Q9R0L9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cd164Q9R0L9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cd164Q9R0L9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cd164Q9R0L9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cd164Q9R0L9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cd164Q9R0L9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cd164Q9R0L9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cd164Q9R0L9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cd164Q9R0L9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cd164Q9R0L9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cd164Q9R0L9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cd164Q9R0L9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cd164Q9R0L9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cd164Q9R0L9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cd164Q9R0L9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Cd164Q9R0L9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cd164Q9R0L9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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Cd164Q9R0L9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cd164Q9R0L9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cd164Q9R0L9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cd164Q9R0L9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cd164Q9R0L9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cd164Q9R0L9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cd164Q9R0L9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cd164Q9R0L9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cd164Q9R0L9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cd164Q9R0L9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cd164Q9R0L9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cd164Q9R0L9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cd164Q9R0L9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cd164Q9R0L9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cd164Q9R0L9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cd164Q9R0L9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cd164Q9R0L9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cd164Q9R0L9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cd164Q9R0L9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Cd164Q9R0L9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cd164Q9R0L9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cd164Q9R0L9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cd164Q9R0L9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Cd164Q9R0L9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cd164Q9R0L9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cd164Q9R0L9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cd164Q9R0L9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cd164Q9R0L9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cd164Q9R0L9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cd164Q9R0L9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cd164Q9R0L9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Cd164Q9R0L9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cd164Q9R0L9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cd164Q9R0L9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cd164Q9R0L9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cd164Q9R0L9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cd164Q9R0L9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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Cd164Q9R0L9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cd164Q9R0L9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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Cd164Q9R0L9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cd164Q9R0L9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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Cd164Q9R0L9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cd164Q9R0L9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cd164Q9R0L9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cd164Q9R0L9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cd164Q9R0L9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cd164Q9R0L9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cd164Q9R0L9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cd164Q9R0L9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cd164Q9R0L9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cd164Q9R0L9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cd164Q9R0L9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cd164Q9R0L9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cd164Q9R0L9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cd164Q9R0L9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cd164Q9R0L9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cd164Q9R0L9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Cd164Q9R0L9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cd164Q9R0L9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cd164Q9R0L9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cd164Q9R0L9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cd164Q9R0L9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cd164Q9R0L9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cd164Q9R0L9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cd164Q9R0L9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cd164Q9R0L9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cd164Q9R0L9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cd164Q9R0L9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cd164Q9R0L9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cd164Q9R0L9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cd164Q9R0L9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cd164Q9R0L9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms