Protein–RNA interactions for Protein: Q9R059

Fhl3, Four and a half LIM domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhl3Q9R059 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fhl3Q9R059 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fhl3Q9R059 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fhl3Q9R059 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fhl3Q9R059 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fhl3Q9R059 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fhl3Q9R059 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fhl3Q9R059 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fhl3Q9R059 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fhl3Q9R059 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fhl3Q9R059 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fhl3Q9R059 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Fhl3Q9R059 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fhl3Q9R059 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fhl3Q9R059 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Fhl3Q9R059 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fhl3Q9R059 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fhl3Q9R059 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fhl3Q9R059 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fhl3Q9R059 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fhl3Q9R059 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fhl3Q9R059 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fhl3Q9R059 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fhl3Q9R059 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fhl3Q9R059 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fhl3Q9R059 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fhl3Q9R059 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fhl3Q9R059 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Fhl3Q9R059 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fhl3Q9R059 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fhl3Q9R059 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fhl3Q9R059 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fhl3Q9R059 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fhl3Q9R059 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fhl3Q9R059 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fhl3Q9R059 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fhl3Q9R059 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fhl3Q9R059 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Fhl3Q9R059 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fhl3Q9R059 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fhl3Q9R059 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fhl3Q9R059 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fhl3Q9R059 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fhl3Q9R059 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fhl3Q9R059 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fhl3Q9R059 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fhl3Q9R059 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fhl3Q9R059 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fhl3Q9R059 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fhl3Q9R059 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fhl3Q9R059 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fhl3Q9R059 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fhl3Q9R059 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fhl3Q9R059 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fhl3Q9R059 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fhl3Q9R059 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fhl3Q9R059 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fhl3Q9R059 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fhl3Q9R059 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Fhl3Q9R059 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fhl3Q9R059 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fhl3Q9R059 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fhl3Q9R059 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fhl3Q9R059 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fhl3Q9R059 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Fhl3Q9R059 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fhl3Q9R059 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fhl3Q9R059 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fhl3Q9R059 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fhl3Q9R059 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fhl3Q9R059 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fhl3Q9R059 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fhl3Q9R059 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fhl3Q9R059 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fhl3Q9R059 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fhl3Q9R059 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fhl3Q9R059 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fhl3Q9R059 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fhl3Q9R059 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fhl3Q9R059 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fhl3Q9R059 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fhl3Q9R059 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fhl3Q9R059 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fhl3Q9R059 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fhl3Q9R059 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Fhl3Q9R059 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fhl3Q9R059 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fhl3Q9R059 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fhl3Q9R059 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Fhl3Q9R059 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fhl3Q9R059 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fhl3Q9R059 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fhl3Q9R059 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fhl3Q9R059 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fhl3Q9R059 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fhl3Q9R059 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fhl3Q9R059 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fhl3Q9R059 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fhl3Q9R059 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fhl3Q9R059 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms