Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Npas3Q9QZQ0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Npas3Q9QZQ0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Npas3Q9QZQ0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Npas3Q9QZQ0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Npas3Q9QZQ0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Npas3Q9QZQ0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Npas3Q9QZQ0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Npas3Q9QZQ0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Npas3Q9QZQ0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Npas3Q9QZQ0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Npas3Q9QZQ0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Npas3Q9QZQ0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Npas3Q9QZQ0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Npas3Q9QZQ0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Npas3Q9QZQ0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Npas3Q9QZQ0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Npas3Q9QZQ0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Npas3Q9QZQ0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Npas3Q9QZQ0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Npas3Q9QZQ0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Npas3Q9QZQ0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Npas3Q9QZQ0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Npas3Q9QZQ0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Npas3Q9QZQ0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Npas3Q9QZQ0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Npas3Q9QZQ0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Npas3Q9QZQ0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Npas3Q9QZQ0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Npas3Q9QZQ0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Npas3Q9QZQ0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Npas3Q9QZQ0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Npas3Q9QZQ0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Npas3Q9QZQ0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Npas3Q9QZQ0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Npas3Q9QZQ0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Npas3Q9QZQ0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Npas3Q9QZQ0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Npas3Q9QZQ0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Npas3Q9QZQ0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Npas3Q9QZQ0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Npas3Q9QZQ0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Npas3Q9QZQ0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Npas3Q9QZQ0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Npas3Q9QZQ0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Npas3Q9QZQ0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Npas3Q9QZQ0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Npas3Q9QZQ0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Npas3Q9QZQ0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Npas3Q9QZQ0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Npas3Q9QZQ0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Npas3Q9QZQ0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Npas3Q9QZQ0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Npas3Q9QZQ0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Npas3Q9QZQ0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Npas3Q9QZQ0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Npas3Q9QZQ0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Npas3Q9QZQ0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Npas3Q9QZQ0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Npas3Q9QZQ0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Npas3Q9QZQ0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Npas3Q9QZQ0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Npas3Q9QZQ0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Npas3Q9QZQ0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Npas3Q9QZQ0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Npas3Q9QZQ0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Npas3Q9QZQ0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Npas3Q9QZQ0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Npas3Q9QZQ0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Npas3Q9QZQ0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Npas3Q9QZQ0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Npas3Q9QZQ0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Npas3Q9QZQ0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Npas3Q9QZQ0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Npas3Q9QZQ0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Npas3Q9QZQ0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Npas3Q9QZQ0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Npas3Q9QZQ0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Npas3Q9QZQ0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Npas3Q9QZQ0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Npas3Q9QZQ0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Npas3Q9QZQ0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Npas3Q9QZQ0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Npas3Q9QZQ0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Npas3Q9QZQ0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Npas3Q9QZQ0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Npas3Q9QZQ0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Npas3Q9QZQ0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Npas3Q9QZQ0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Npas3Q9QZQ0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Npas3Q9QZQ0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Npas3Q9QZQ0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Npas3Q9QZQ0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Npas3Q9QZQ0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Npas3Q9QZQ0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Npas3Q9QZQ0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Npas3Q9QZQ0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Npas3Q9QZQ0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Npas3Q9QZQ0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Npas3Q9QZQ0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms