Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE2

Clnk, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClnkQ9QZE2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ClnkQ9QZE2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ClnkQ9QZE2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ClnkQ9QZE2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ClnkQ9QZE2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ClnkQ9QZE2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ClnkQ9QZE2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ClnkQ9QZE2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ClnkQ9QZE2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ClnkQ9QZE2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ClnkQ9QZE2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ClnkQ9QZE2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ClnkQ9QZE2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ClnkQ9QZE2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ClnkQ9QZE2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ClnkQ9QZE2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ClnkQ9QZE2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ClnkQ9QZE2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ClnkQ9QZE2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ClnkQ9QZE2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ClnkQ9QZE2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ClnkQ9QZE2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ClnkQ9QZE2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ClnkQ9QZE2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ClnkQ9QZE2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ClnkQ9QZE2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ClnkQ9QZE2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ClnkQ9QZE2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ClnkQ9QZE2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ClnkQ9QZE2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ClnkQ9QZE2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ClnkQ9QZE2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ClnkQ9QZE2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ClnkQ9QZE2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ClnkQ9QZE2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ClnkQ9QZE2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ClnkQ9QZE2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ClnkQ9QZE2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ClnkQ9QZE2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ClnkQ9QZE2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ClnkQ9QZE2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ClnkQ9QZE2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ClnkQ9QZE2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ClnkQ9QZE2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ClnkQ9QZE2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ClnkQ9QZE2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ClnkQ9QZE2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ClnkQ9QZE2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ClnkQ9QZE2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ClnkQ9QZE2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ClnkQ9QZE2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ClnkQ9QZE2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ClnkQ9QZE2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ClnkQ9QZE2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ClnkQ9QZE2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ClnkQ9QZE2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ClnkQ9QZE2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ClnkQ9QZE2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ClnkQ9QZE2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ClnkQ9QZE2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ClnkQ9QZE2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ClnkQ9QZE2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ClnkQ9QZE2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ClnkQ9QZE2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ClnkQ9QZE2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ClnkQ9QZE2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ClnkQ9QZE2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ClnkQ9QZE2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ClnkQ9QZE2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ClnkQ9QZE2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ClnkQ9QZE2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ClnkQ9QZE2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ClnkQ9QZE2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ClnkQ9QZE2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ClnkQ9QZE2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ClnkQ9QZE2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ClnkQ9QZE2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ClnkQ9QZE2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ClnkQ9QZE2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ClnkQ9QZE2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ClnkQ9QZE2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ClnkQ9QZE2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ClnkQ9QZE2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ClnkQ9QZE2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ClnkQ9QZE2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ClnkQ9QZE2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ClnkQ9QZE2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ClnkQ9QZE2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ClnkQ9QZE2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ClnkQ9QZE2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ClnkQ9QZE2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ClnkQ9QZE2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ClnkQ9QZE2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ClnkQ9QZE2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ClnkQ9QZE2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ClnkQ9QZE2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ClnkQ9QZE2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ClnkQ9QZE2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ClnkQ9QZE2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ClnkQ9QZE2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms