Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYM9

Tmeff2, Tomoregulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff2Q9QYM9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmeff2Q9QYM9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmeff2Q9QYM9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmeff2Q9QYM9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmeff2Q9QYM9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmeff2Q9QYM9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmeff2Q9QYM9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmeff2Q9QYM9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmeff2Q9QYM9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmeff2Q9QYM9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmeff2Q9QYM9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmeff2Q9QYM9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmeff2Q9QYM9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmeff2Q9QYM9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmeff2Q9QYM9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmeff2Q9QYM9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmeff2Q9QYM9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmeff2Q9QYM9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmeff2Q9QYM9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmeff2Q9QYM9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmeff2Q9QYM9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmeff2Q9QYM9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmeff2Q9QYM9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmeff2Q9QYM9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmeff2Q9QYM9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmeff2Q9QYM9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmeff2Q9QYM9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmeff2Q9QYM9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmeff2Q9QYM9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmeff2Q9QYM9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmeff2Q9QYM9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmeff2Q9QYM9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmeff2Q9QYM9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmeff2Q9QYM9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmeff2Q9QYM9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmeff2Q9QYM9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmeff2Q9QYM9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmeff2Q9QYM9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmeff2Q9QYM9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmeff2Q9QYM9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmeff2Q9QYM9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmeff2Q9QYM9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmeff2Q9QYM9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmeff2Q9QYM9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmeff2Q9QYM9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmeff2Q9QYM9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmeff2Q9QYM9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmeff2Q9QYM9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmeff2Q9QYM9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmeff2Q9QYM9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmeff2Q9QYM9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmeff2Q9QYM9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmeff2Q9QYM9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmeff2Q9QYM9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmeff2Q9QYM9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmeff2Q9QYM9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmeff2Q9QYM9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmeff2Q9QYM9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmeff2Q9QYM9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmeff2Q9QYM9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmeff2Q9QYM9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmeff2Q9QYM9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmeff2Q9QYM9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmeff2Q9QYM9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tmeff2Q9QYM9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tmeff2Q9QYM9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmeff2Q9QYM9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmeff2Q9QYM9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmeff2Q9QYM9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmeff2Q9QYM9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmeff2Q9QYM9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmeff2Q9QYM9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmeff2Q9QYM9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmeff2Q9QYM9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmeff2Q9QYM9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmeff2Q9QYM9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmeff2Q9QYM9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmeff2Q9QYM9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmeff2Q9QYM9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmeff2Q9QYM9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmeff2Q9QYM9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmeff2Q9QYM9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmeff2Q9QYM9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmeff2Q9QYM9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmeff2Q9QYM9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmeff2Q9QYM9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmeff2Q9QYM9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmeff2Q9QYM9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmeff2Q9QYM9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmeff2Q9QYM9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmeff2Q9QYM9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmeff2Q9QYM9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmeff2Q9QYM9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmeff2Q9QYM9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmeff2Q9QYM9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmeff2Q9QYM9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmeff2Q9QYM9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmeff2Q9QYM9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmeff2Q9QYM9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmeff2Q9QYM9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms