Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim44Q9QXA7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim44Q9QXA7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim44Q9QXA7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim44Q9QXA7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim44Q9QXA7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim44Q9QXA7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim44Q9QXA7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim44Q9QXA7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim44Q9QXA7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim44Q9QXA7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim44Q9QXA7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim44Q9QXA7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim44Q9QXA7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim44Q9QXA7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim44Q9QXA7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim44Q9QXA7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim44Q9QXA7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim44Q9QXA7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim44Q9QXA7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim44Q9QXA7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim44Q9QXA7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim44Q9QXA7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim44Q9QXA7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim44Q9QXA7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim44Q9QXA7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim44Q9QXA7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim44Q9QXA7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim44Q9QXA7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim44Q9QXA7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim44Q9QXA7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim44Q9QXA7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim44Q9QXA7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim44Q9QXA7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim44Q9QXA7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim44Q9QXA7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim44Q9QXA7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim44Q9QXA7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim44Q9QXA7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim44Q9QXA7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim44Q9QXA7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim44Q9QXA7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim44Q9QXA7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim44Q9QXA7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim44Q9QXA7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim44Q9QXA7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim44Q9QXA7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim44Q9QXA7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim44Q9QXA7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim44Q9QXA7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim44Q9QXA7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim44Q9QXA7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim44Q9QXA7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim44Q9QXA7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim44Q9QXA7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim44Q9QXA7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim44Q9QXA7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim44Q9QXA7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim44Q9QXA7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim44Q9QXA7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim44Q9QXA7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim44Q9QXA7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim44Q9QXA7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim44Q9QXA7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim44Q9QXA7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim44Q9QXA7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim44Q9QXA7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim44Q9QXA7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim44Q9QXA7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim44Q9QXA7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim44Q9QXA7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim44Q9QXA7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim44Q9QXA7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim44Q9QXA7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim44Q9QXA7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim44Q9QXA7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim44Q9QXA7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim44Q9QXA7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim44Q9QXA7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim44Q9QXA7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim44Q9QXA7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim44Q9QXA7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim44Q9QXA7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim44Q9QXA7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim44Q9QXA7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim44Q9QXA7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim44Q9QXA7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim44Q9QXA7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim44Q9QXA7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trim44Q9QXA7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trim44Q9QXA7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim44Q9QXA7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim44Q9QXA7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim44Q9QXA7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim44Q9QXA7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim44Q9QXA7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim44Q9QXA7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim44Q9QXA7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim44Q9QXA7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim44Q9QXA7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms