Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX98

Ptf1a, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptf1aQ9QX98 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ptf1aQ9QX98 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ptf1aQ9QX98 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ptf1aQ9QX98 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ptf1aQ9QX98 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ptf1aQ9QX98 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ptf1aQ9QX98 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ptf1aQ9QX98 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ptf1aQ9QX98 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ptf1aQ9QX98 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ptf1aQ9QX98 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ptf1aQ9QX98 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ptf1aQ9QX98 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ptf1aQ9QX98 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ptf1aQ9QX98 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ptf1aQ9QX98 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ptf1aQ9QX98 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ptf1aQ9QX98 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ptf1aQ9QX98 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ptf1aQ9QX98 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ptf1aQ9QX98 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ptf1aQ9QX98 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ptf1aQ9QX98 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ptf1aQ9QX98 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ptf1aQ9QX98 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ptf1aQ9QX98 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ptf1aQ9QX98 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ptf1aQ9QX98 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ptf1aQ9QX98 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ptf1aQ9QX98 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Ptf1aQ9QX98 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Ptf1aQ9QX98 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ptf1aQ9QX98 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ptf1aQ9QX98 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ptf1aQ9QX98 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Ptf1aQ9QX98 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ptf1aQ9QX98 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Ptf1aQ9QX98 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ptf1aQ9QX98 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ptf1aQ9QX98 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ptf1aQ9QX98 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ptf1aQ9QX98 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ptf1aQ9QX98 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ptf1aQ9QX98 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Ptf1aQ9QX98 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ptf1aQ9QX98 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ptf1aQ9QX98 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ptf1aQ9QX98 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Ptf1aQ9QX98 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Ptf1aQ9QX98 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ptf1aQ9QX98 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ptf1aQ9QX98 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ptf1aQ9QX98 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ptf1aQ9QX98 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Ptf1aQ9QX98 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ptf1aQ9QX98 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ptf1aQ9QX98 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ptf1aQ9QX98 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ptf1aQ9QX98 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ptf1aQ9QX98 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ptf1aQ9QX98 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ptf1aQ9QX98 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ptf1aQ9QX98 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ptf1aQ9QX98 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ptf1aQ9QX98 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ptf1aQ9QX98 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ptf1aQ9QX98 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Ptf1aQ9QX98 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ptf1aQ9QX98 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ptf1aQ9QX98 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ptf1aQ9QX98 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ptf1aQ9QX98 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ptf1aQ9QX98 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ptf1aQ9QX98 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ptf1aQ9QX98 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ptf1aQ9QX98 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ptf1aQ9QX98 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ptf1aQ9QX98 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ptf1aQ9QX98 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ptf1aQ9QX98 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ptf1aQ9QX98 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ptf1aQ9QX98 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ptf1aQ9QX98 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ptf1aQ9QX98 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ptf1aQ9QX98 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Ptf1aQ9QX98 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ptf1aQ9QX98 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ptf1aQ9QX98 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ptf1aQ9QX98 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ptf1aQ9QX98 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ptf1aQ9QX98 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ptf1aQ9QX98 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ptf1aQ9QX98 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ptf1aQ9QX98 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ptf1aQ9QX98 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ptf1aQ9QX98 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ptf1aQ9QX98 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ptf1aQ9QX98 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Ptf1aQ9QX98 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ptf1aQ9QX98 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms