Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PdcQ9QW08 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PdcQ9QW08 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PdcQ9QW08 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PdcQ9QW08 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PdcQ9QW08 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PdcQ9QW08 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PdcQ9QW08 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PdcQ9QW08 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PdcQ9QW08 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PdcQ9QW08 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PdcQ9QW08 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PdcQ9QW08 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PdcQ9QW08 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PdcQ9QW08 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PdcQ9QW08 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PdcQ9QW08 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PdcQ9QW08 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PdcQ9QW08 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PdcQ9QW08 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PdcQ9QW08 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PdcQ9QW08 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PdcQ9QW08 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PdcQ9QW08 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PdcQ9QW08 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PdcQ9QW08 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PdcQ9QW08 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PdcQ9QW08 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PdcQ9QW08 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PdcQ9QW08 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PdcQ9QW08 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PdcQ9QW08 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PdcQ9QW08 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PdcQ9QW08 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PdcQ9QW08 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PdcQ9QW08 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PdcQ9QW08 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PdcQ9QW08 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PdcQ9QW08 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PdcQ9QW08 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PdcQ9QW08 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PdcQ9QW08 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PdcQ9QW08 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PdcQ9QW08 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PdcQ9QW08 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PdcQ9QW08 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PdcQ9QW08 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PdcQ9QW08 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PdcQ9QW08 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PdcQ9QW08 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PdcQ9QW08 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PdcQ9QW08 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PdcQ9QW08 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PdcQ9QW08 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PdcQ9QW08 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PdcQ9QW08 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PdcQ9QW08 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PdcQ9QW08 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PdcQ9QW08 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PdcQ9QW08 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PdcQ9QW08 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PdcQ9QW08 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PdcQ9QW08 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PdcQ9QW08 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PdcQ9QW08 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PdcQ9QW08 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PdcQ9QW08 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PdcQ9QW08 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PdcQ9QW08 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PdcQ9QW08 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PdcQ9QW08 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PdcQ9QW08 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PdcQ9QW08 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PdcQ9QW08 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PdcQ9QW08 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PdcQ9QW08 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PdcQ9QW08 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PdcQ9QW08 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PdcQ9QW08 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PdcQ9QW08 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PdcQ9QW08 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PdcQ9QW08 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PdcQ9QW08 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PdcQ9QW08 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PdcQ9QW08 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PdcQ9QW08 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PdcQ9QW08 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PdcQ9QW08 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PdcQ9QW08 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PdcQ9QW08 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PdcQ9QW08 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PdcQ9QW08 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PdcQ9QW08 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PdcQ9QW08 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PdcQ9QW08 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PdcQ9QW08 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PdcQ9QW08 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PdcQ9QW08 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PdcQ9QW08 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PdcQ9QW08 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms