Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Dkk3Q9QUN9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Dkk3Q9QUN9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Dkk3Q9QUN9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Dkk3Q9QUN9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Dkk3Q9QUN9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Dkk3Q9QUN9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Dkk3Q9QUN9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Dkk3Q9QUN9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Dkk3Q9QUN9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Dkk3Q9QUN9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Dkk3Q9QUN9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dkk3Q9QUN9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dkk3Q9QUN9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dkk3Q9QUN9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dkk3Q9QUN9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dkk3Q9QUN9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dkk3Q9QUN9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dkk3Q9QUN9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dkk3Q9QUN9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Dkk3Q9QUN9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Dkk3Q9QUN9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Dkk3Q9QUN9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Dkk3Q9QUN9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Dkk3Q9QUN9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Dkk3Q9QUN9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Dkk3Q9QUN9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Dkk3Q9QUN9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Dkk3Q9QUN9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Dkk3Q9QUN9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Dkk3Q9QUN9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Dkk3Q9QUN9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dkk3Q9QUN9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dkk3Q9QUN9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Dkk3Q9QUN9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Dkk3Q9QUN9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dkk3Q9QUN9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dkk3Q9QUN9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dkk3Q9QUN9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Dkk3Q9QUN9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Dkk3Q9QUN9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dkk3Q9QUN9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dkk3Q9QUN9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dkk3Q9QUN9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Dkk3Q9QUN9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dkk3Q9QUN9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Dkk3Q9QUN9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Dkk3Q9QUN9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Dkk3Q9QUN9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Dkk3Q9QUN9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Dkk3Q9QUN9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Dkk3Q9QUN9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Dkk3Q9QUN9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Dkk3Q9QUN9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Dkk3Q9QUN9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Dkk3Q9QUN9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Dkk3Q9QUN9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Dkk3Q9QUN9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.7■□□□□ 0.91
Dkk3Q9QUN9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Dkk3Q9QUN9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Dkk3Q9QUN9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Dkk3Q9QUN9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Dkk3Q9QUN9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Dkk3Q9QUN9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Dkk3Q9QUN9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Dkk3Q9QUN9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Dkk3Q9QUN9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Dkk3Q9QUN9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Dkk3Q9QUN9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Dkk3Q9QUN9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Dkk3Q9QUN9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Dkk3Q9QUN9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Dkk3Q9QUN9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Dkk3Q9QUN9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Dkk3Q9QUN9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Dkk3Q9QUN9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Dkk3Q9QUN9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Dkk3Q9QUN9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Dkk3Q9QUN9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Dkk3Q9QUN9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Dkk3Q9QUN9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Dkk3Q9QUN9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Dkk3Q9QUN9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Dkk3Q9QUN9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Dkk3Q9QUN9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Dkk3Q9QUN9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Dkk3Q9QUN9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Dkk3Q9QUN9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Dkk3Q9QUN9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Dkk3Q9QUN9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Dkk3Q9QUN9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Dkk3Q9QUN9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Dkk3Q9QUN9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Dkk3Q9QUN9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Dkk3Q9QUN9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Dkk3Q9QUN9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Dkk3Q9QUN9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dkk3Q9QUN9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dkk3Q9QUN9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dkk3Q9QUN9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms