Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME5

Ap3b2, AP-3 complex subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b2Q9JME5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ap3b2Q9JME5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ap3b2Q9JME5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ap3b2Q9JME5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ap3b2Q9JME5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ap3b2Q9JME5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ap3b2Q9JME5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ap3b2Q9JME5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ap3b2Q9JME5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ap3b2Q9JME5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ap3b2Q9JME5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Ap3b2Q9JME5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ap3b2Q9JME5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ap3b2Q9JME5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ap3b2Q9JME5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ap3b2Q9JME5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ap3b2Q9JME5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ap3b2Q9JME5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ap3b2Q9JME5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Ap3b2Q9JME5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ap3b2Q9JME5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ap3b2Q9JME5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ap3b2Q9JME5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ap3b2Q9JME5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ap3b2Q9JME5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ap3b2Q9JME5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ap3b2Q9JME5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ap3b2Q9JME5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ap3b2Q9JME5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ap3b2Q9JME5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ap3b2Q9JME5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ap3b2Q9JME5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ap3b2Q9JME5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ap3b2Q9JME5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ap3b2Q9JME5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ap3b2Q9JME5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ap3b2Q9JME5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ap3b2Q9JME5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Ap3b2Q9JME5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ap3b2Q9JME5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ap3b2Q9JME5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ap3b2Q9JME5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ap3b2Q9JME5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ap3b2Q9JME5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ap3b2Q9JME5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ap3b2Q9JME5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ap3b2Q9JME5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ap3b2Q9JME5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ap3b2Q9JME5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ap3b2Q9JME5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ap3b2Q9JME5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Ap3b2Q9JME5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ap3b2Q9JME5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ap3b2Q9JME5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ap3b2Q9JME5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ap3b2Q9JME5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Ap3b2Q9JME5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ap3b2Q9JME5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ap3b2Q9JME5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ap3b2Q9JME5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ap3b2Q9JME5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ap3b2Q9JME5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Ap3b2Q9JME5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ap3b2Q9JME5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ap3b2Q9JME5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ap3b2Q9JME5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ap3b2Q9JME5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ap3b2Q9JME5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ap3b2Q9JME5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ap3b2Q9JME5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ap3b2Q9JME5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ap3b2Q9JME5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ap3b2Q9JME5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ap3b2Q9JME5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ap3b2Q9JME5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ap3b2Q9JME5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ap3b2Q9JME5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ap3b2Q9JME5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ap3b2Q9JME5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ap3b2Q9JME5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ap3b2Q9JME5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ap3b2Q9JME5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ap3b2Q9JME5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Ap3b2Q9JME5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ap3b2Q9JME5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ap3b2Q9JME5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ap3b2Q9JME5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ap3b2Q9JME5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ap3b2Q9JME5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ap3b2Q9JME5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Ap3b2Q9JME5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ap3b2Q9JME5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ap3b2Q9JME5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ap3b2Q9JME5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ap3b2Q9JME5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ap3b2Q9JME5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Ap3b2Q9JME5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
Ap3b2Q9JME5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ap3b2Q9JME5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ap3b2Q9JME5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms