Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB8

Cntn6, Contactin-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn6Q9JMB8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cntn6Q9JMB8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cntn6Q9JMB8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cntn6Q9JMB8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cntn6Q9JMB8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cntn6Q9JMB8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cntn6Q9JMB8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cntn6Q9JMB8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cntn6Q9JMB8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cntn6Q9JMB8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cntn6Q9JMB8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cntn6Q9JMB8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cntn6Q9JMB8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cntn6Q9JMB8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cntn6Q9JMB8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cntn6Q9JMB8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cntn6Q9JMB8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cntn6Q9JMB8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cntn6Q9JMB8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cntn6Q9JMB8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Cntn6Q9JMB8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cntn6Q9JMB8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cntn6Q9JMB8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cntn6Q9JMB8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cntn6Q9JMB8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cntn6Q9JMB8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cntn6Q9JMB8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cntn6Q9JMB8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cntn6Q9JMB8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cntn6Q9JMB8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cntn6Q9JMB8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cntn6Q9JMB8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cntn6Q9JMB8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cntn6Q9JMB8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cntn6Q9JMB8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cntn6Q9JMB8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cntn6Q9JMB8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cntn6Q9JMB8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cntn6Q9JMB8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cntn6Q9JMB8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cntn6Q9JMB8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cntn6Q9JMB8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cntn6Q9JMB8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cntn6Q9JMB8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cntn6Q9JMB8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cntn6Q9JMB8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cntn6Q9JMB8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cntn6Q9JMB8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cntn6Q9JMB8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cntn6Q9JMB8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cntn6Q9JMB8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cntn6Q9JMB8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cntn6Q9JMB8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cntn6Q9JMB8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cntn6Q9JMB8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cntn6Q9JMB8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cntn6Q9JMB8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cntn6Q9JMB8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cntn6Q9JMB8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cntn6Q9JMB8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cntn6Q9JMB8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cntn6Q9JMB8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cntn6Q9JMB8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cntn6Q9JMB8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cntn6Q9JMB8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cntn6Q9JMB8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cntn6Q9JMB8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cntn6Q9JMB8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cntn6Q9JMB8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cntn6Q9JMB8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cntn6Q9JMB8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cntn6Q9JMB8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cntn6Q9JMB8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cntn6Q9JMB8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cntn6Q9JMB8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cntn6Q9JMB8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cntn6Q9JMB8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cntn6Q9JMB8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cntn6Q9JMB8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cntn6Q9JMB8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cntn6Q9JMB8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cntn6Q9JMB8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cntn6Q9JMB8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cntn6Q9JMB8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cntn6Q9JMB8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cntn6Q9JMB8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cntn6Q9JMB8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cntn6Q9JMB8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cntn6Q9JMB8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cntn6Q9JMB8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cntn6Q9JMB8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cntn6Q9JMB8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cntn6Q9JMB8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cntn6Q9JMB8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cntn6Q9JMB8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cntn6Q9JMB8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cntn6Q9JMB8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cntn6Q9JMB8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cntn6Q9JMB8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cntn6Q9JMB8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms