Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV6

Pnkp, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkpQ9JLV6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PnkpQ9JLV6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PnkpQ9JLV6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PnkpQ9JLV6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PnkpQ9JLV6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PnkpQ9JLV6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PnkpQ9JLV6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PnkpQ9JLV6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PnkpQ9JLV6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PnkpQ9JLV6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PnkpQ9JLV6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PnkpQ9JLV6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PnkpQ9JLV6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PnkpQ9JLV6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PnkpQ9JLV6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PnkpQ9JLV6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PnkpQ9JLV6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PnkpQ9JLV6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PnkpQ9JLV6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PnkpQ9JLV6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PnkpQ9JLV6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PnkpQ9JLV6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PnkpQ9JLV6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PnkpQ9JLV6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms