Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG8

Capn15, Calpain-15, mousemouse

Predictions only

Length 1,095 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn15Q9JLG8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Capn15Q9JLG8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Capn15Q9JLG8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Capn15Q9JLG8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Capn15Q9JLG8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Capn15Q9JLG8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Capn15Q9JLG8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Capn15Q9JLG8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Capn15Q9JLG8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Capn15Q9JLG8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Capn15Q9JLG8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Capn15Q9JLG8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Capn15Q9JLG8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Capn15Q9JLG8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Capn15Q9JLG8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Capn15Q9JLG8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Capn15Q9JLG8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Capn15Q9JLG8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Capn15Q9JLG8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Capn15Q9JLG8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Capn15Q9JLG8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Capn15Q9JLG8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capn15Q9JLG8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capn15Q9JLG8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Capn15Q9JLG8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capn15Q9JLG8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Capn15Q9JLG8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Capn15Q9JLG8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Capn15Q9JLG8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Capn15Q9JLG8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Capn15Q9JLG8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Capn15Q9JLG8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Capn15Q9JLG8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Capn15Q9JLG8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Capn15Q9JLG8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn15Q9JLG8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn15Q9JLG8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn15Q9JLG8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn15Q9JLG8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn15Q9JLG8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn15Q9JLG8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn15Q9JLG8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn15Q9JLG8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn15Q9JLG8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn15Q9JLG8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn15Q9JLG8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Capn15Q9JLG8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Capn15Q9JLG8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Capn15Q9JLG8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Capn15Q9JLG8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Capn15Q9JLG8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Capn15Q9JLG8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Capn15Q9JLG8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capn15Q9JLG8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capn15Q9JLG8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capn15Q9JLG8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capn15Q9JLG8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capn15Q9JLG8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capn15Q9JLG8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capn15Q9JLG8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capn15Q9JLG8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capn15Q9JLG8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capn15Q9JLG8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capn15Q9JLG8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Capn15Q9JLG8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capn15Q9JLG8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Capn15Q9JLG8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capn15Q9JLG8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Capn15Q9JLG8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Capn15Q9JLG8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Capn15Q9JLG8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Capn15Q9JLG8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Capn15Q9JLG8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Capn15Q9JLG8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Capn15Q9JLG8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Capn15Q9JLG8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn15Q9JLG8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn15Q9JLG8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn15Q9JLG8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn15Q9JLG8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn15Q9JLG8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn15Q9JLG8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn15Q9JLG8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn15Q9JLG8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn15Q9JLG8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn15Q9JLG8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn15Q9JLG8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn15Q9JLG8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn15Q9JLG8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn15Q9JLG8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn15Q9JLG8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn15Q9JLG8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Capn15Q9JLG8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Capn15Q9JLG8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Capn15Q9JLG8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Capn15Q9JLG8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Capn15Q9JLG8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Capn15Q9JLG8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Capn15Q9JLG8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Capn15Q9JLG8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms