Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chrac1Q9JKP8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chrac1Q9JKP8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chrac1Q9JKP8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chrac1Q9JKP8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chrac1Q9JKP8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chrac1Q9JKP8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chrac1Q9JKP8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrac1Q9JKP8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrac1Q9JKP8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrac1Q9JKP8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrac1Q9JKP8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chrac1Q9JKP8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chrac1Q9JKP8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chrac1Q9JKP8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chrac1Q9JKP8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chrac1Q9JKP8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chrac1Q9JKP8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chrac1Q9JKP8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chrac1Q9JKP8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Chrac1Q9JKP8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chrac1Q9JKP8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chrac1Q9JKP8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chrac1Q9JKP8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Chrac1Q9JKP8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chrac1Q9JKP8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chrac1Q9JKP8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chrac1Q9JKP8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chrac1Q9JKP8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chrac1Q9JKP8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chrac1Q9JKP8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chrac1Q9JKP8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chrac1Q9JKP8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chrac1Q9JKP8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chrac1Q9JKP8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chrac1Q9JKP8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chrac1Q9JKP8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Chrac1Q9JKP8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chrac1Q9JKP8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Chrac1Q9JKP8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chrac1Q9JKP8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chrac1Q9JKP8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chrac1Q9JKP8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chrac1Q9JKP8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chrac1Q9JKP8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chrac1Q9JKP8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chrac1Q9JKP8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chrac1Q9JKP8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chrac1Q9JKP8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chrac1Q9JKP8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Chrac1Q9JKP8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chrac1Q9JKP8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chrac1Q9JKP8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chrac1Q9JKP8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chrac1Q9JKP8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chrac1Q9JKP8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chrac1Q9JKP8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chrac1Q9JKP8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Chrac1Q9JKP8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chrac1Q9JKP8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chrac1Q9JKP8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chrac1Q9JKP8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Chrac1Q9JKP8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chrac1Q9JKP8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chrac1Q9JKP8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chrac1Q9JKP8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chrac1Q9JKP8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chrac1Q9JKP8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chrac1Q9JKP8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chrac1Q9JKP8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chrac1Q9JKP8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chrac1Q9JKP8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chrac1Q9JKP8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chrac1Q9JKP8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chrac1Q9JKP8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chrac1Q9JKP8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chrac1Q9JKP8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chrac1Q9JKP8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chrac1Q9JKP8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chrac1Q9JKP8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chrac1Q9JKP8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Chrac1Q9JKP8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chrac1Q9JKP8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chrac1Q9JKP8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chrac1Q9JKP8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Chrac1Q9JKP8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chrac1Q9JKP8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chrac1Q9JKP8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chrac1Q9JKP8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chrac1Q9JKP8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Chrac1Q9JKP8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chrac1Q9JKP8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chrac1Q9JKP8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chrac1Q9JKP8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chrac1Q9JKP8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chrac1Q9JKP8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chrac1Q9JKP8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chrac1Q9JKP8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chrac1Q9JKP8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chrac1Q9JKP8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms