Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nova1Q9JKN6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nova1Q9JKN6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nova1Q9JKN6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nova1Q9JKN6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nova1Q9JKN6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nova1Q9JKN6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nova1Q9JKN6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nova1Q9JKN6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nova1Q9JKN6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nova1Q9JKN6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nova1Q9JKN6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nova1Q9JKN6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nova1Q9JKN6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nova1Q9JKN6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nova1Q9JKN6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Nova1Q9JKN6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nova1Q9JKN6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nova1Q9JKN6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nova1Q9JKN6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nova1Q9JKN6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nova1Q9JKN6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Nova1Q9JKN6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nova1Q9JKN6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nova1Q9JKN6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nova1Q9JKN6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nova1Q9JKN6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nova1Q9JKN6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nova1Q9JKN6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nova1Q9JKN6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nova1Q9JKN6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nova1Q9JKN6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Nova1Q9JKN6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nova1Q9JKN6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nova1Q9JKN6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nova1Q9JKN6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nova1Q9JKN6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nova1Q9JKN6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nova1Q9JKN6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nova1Q9JKN6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nova1Q9JKN6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nova1Q9JKN6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nova1Q9JKN6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nova1Q9JKN6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Nova1Q9JKN6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Nova1Q9JKN6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nova1Q9JKN6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nova1Q9JKN6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nova1Q9JKN6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nova1Q9JKN6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nova1Q9JKN6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nova1Q9JKN6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Nova1Q9JKN6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nova1Q9JKN6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nova1Q9JKN6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nova1Q9JKN6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nova1Q9JKN6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nova1Q9JKN6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nova1Q9JKN6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nova1Q9JKN6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nova1Q9JKN6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nova1Q9JKN6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nova1Q9JKN6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nova1Q9JKN6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nova1Q9JKN6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nova1Q9JKN6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nova1Q9JKN6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nova1Q9JKN6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nova1Q9JKN6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nova1Q9JKN6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nova1Q9JKN6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Nova1Q9JKN6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nova1Q9JKN6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nova1Q9JKN6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nova1Q9JKN6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nova1Q9JKN6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nova1Q9JKN6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nova1Q9JKN6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Nova1Q9JKN6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nova1Q9JKN6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nova1Q9JKN6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nova1Q9JKN6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Nova1Q9JKN6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nova1Q9JKN6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nova1Q9JKN6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nova1Q9JKN6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nova1Q9JKN6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nova1Q9JKN6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nova1Q9JKN6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nova1Q9JKN6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nova1Q9JKN6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nova1Q9JKN6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Nova1Q9JKN6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Nova1Q9JKN6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nova1Q9JKN6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nova1Q9JKN6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nova1Q9JKN6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Nova1Q9JKN6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nova1Q9JKN6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nova1Q9JKN6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms