Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Uchl3Q9JKB1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Uchl3Q9JKB1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Uchl3Q9JKB1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Uchl3Q9JKB1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Uchl3Q9JKB1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Uchl3Q9JKB1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Uchl3Q9JKB1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Uchl3Q9JKB1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Uchl3Q9JKB1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Uchl3Q9JKB1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Uchl3Q9JKB1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Uchl3Q9JKB1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Uchl3Q9JKB1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Uchl3Q9JKB1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uchl3Q9JKB1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uchl3Q9JKB1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uchl3Q9JKB1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uchl3Q9JKB1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uchl3Q9JKB1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uchl3Q9JKB1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uchl3Q9JKB1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Uchl3Q9JKB1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Uchl3Q9JKB1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Uchl3Q9JKB1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Uchl3Q9JKB1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Uchl3Q9JKB1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Uchl3Q9JKB1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Uchl3Q9JKB1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Uchl3Q9JKB1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Uchl3Q9JKB1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Uchl3Q9JKB1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Uchl3Q9JKB1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Uchl3Q9JKB1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Uchl3Q9JKB1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uchl3Q9JKB1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uchl3Q9JKB1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uchl3Q9JKB1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uchl3Q9JKB1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uchl3Q9JKB1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uchl3Q9JKB1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Uchl3Q9JKB1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Uchl3Q9JKB1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Uchl3Q9JKB1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Uchl3Q9JKB1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Uchl3Q9JKB1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Uchl3Q9JKB1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Uchl3Q9JKB1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Uchl3Q9JKB1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Uchl3Q9JKB1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Uchl3Q9JKB1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Uchl3Q9JKB1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Uchl3Q9JKB1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Uchl3Q9JKB1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Uchl3Q9JKB1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Uchl3Q9JKB1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Uchl3Q9JKB1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Uchl3Q9JKB1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Uchl3Q9JKB1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Uchl3Q9JKB1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Uchl3Q9JKB1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Uchl3Q9JKB1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Uchl3Q9JKB1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Uchl3Q9JKB1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Uchl3Q9JKB1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Uchl3Q9JKB1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Uchl3Q9JKB1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Uchl3Q9JKB1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Uchl3Q9JKB1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Uchl3Q9JKB1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Uchl3Q9JKB1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Uchl3Q9JKB1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Uchl3Q9JKB1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Uchl3Q9JKB1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Uchl3Q9JKB1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Uchl3Q9JKB1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Uchl3Q9JKB1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Uchl3Q9JKB1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Uchl3Q9JKB1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Uchl3Q9JKB1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Uchl3Q9JKB1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Uchl3Q9JKB1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Uchl3Q9JKB1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Uchl3Q9JKB1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Uchl3Q9JKB1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Uchl3Q9JKB1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Uchl3Q9JKB1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Uchl3Q9JKB1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Uchl3Q9JKB1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Uchl3Q9JKB1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Uchl3Q9JKB1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Uchl3Q9JKB1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Uchl3Q9JKB1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Uchl3Q9JKB1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Uchl3Q9JKB1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Uchl3Q9JKB1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Uchl3Q9JKB1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Uchl3Q9JKB1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Uchl3Q9JKB1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uchl3Q9JKB1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms