Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK97

Kcnq4, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 4, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnq4Q9JK97 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kcnq4Q9JK97 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kcnq4Q9JK97 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kcnq4Q9JK97 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kcnq4Q9JK97 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kcnq4Q9JK97 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kcnq4Q9JK97 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kcnq4Q9JK97 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kcnq4Q9JK97 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kcnq4Q9JK97 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Kcnq4Q9JK97 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Kcnq4Q9JK97 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Kcnq4Q9JK97 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Kcnq4Q9JK97 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Kcnq4Q9JK97 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kcnq4Q9JK97 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kcnq4Q9JK97 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kcnq4Q9JK97 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kcnq4Q9JK97 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kcnq4Q9JK97 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kcnq4Q9JK97 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kcnq4Q9JK97 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kcnq4Q9JK97 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kcnq4Q9JK97 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kcnq4Q9JK97 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kcnq4Q9JK97 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kcnq4Q9JK97 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kcnq4Q9JK97 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kcnq4Q9JK97 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kcnq4Q9JK97 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kcnq4Q9JK97 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kcnq4Q9JK97 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kcnq4Q9JK97 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kcnq4Q9JK97 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kcnq4Q9JK97 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kcnq4Q9JK97 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kcnq4Q9JK97 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kcnq4Q9JK97 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kcnq4Q9JK97 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Kcnq4Q9JK97 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kcnq4Q9JK97 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kcnq4Q9JK97 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kcnq4Q9JK97 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Kcnq4Q9JK97 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kcnq4Q9JK97 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Kcnq4Q9JK97 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kcnq4Q9JK97 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kcnq4Q9JK97 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kcnq4Q9JK97 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kcnq4Q9JK97 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kcnq4Q9JK97 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kcnq4Q9JK97 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kcnq4Q9JK97 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kcnq4Q9JK97 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kcnq4Q9JK97 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kcnq4Q9JK97 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kcnq4Q9JK97 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kcnq4Q9JK97 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kcnq4Q9JK97 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kcnq4Q9JK97 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kcnq4Q9JK97 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kcnq4Q9JK97 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kcnq4Q9JK97 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kcnq4Q9JK97 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kcnq4Q9JK97 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kcnq4Q9JK97 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kcnq4Q9JK97 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kcnq4Q9JK97 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kcnq4Q9JK97 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kcnq4Q9JK97 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kcnq4Q9JK97 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kcnq4Q9JK97 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Kcnq4Q9JK97 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kcnq4Q9JK97 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kcnq4Q9JK97 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kcnq4Q9JK97 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kcnq4Q9JK97 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kcnq4Q9JK97 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kcnq4Q9JK97 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kcnq4Q9JK97 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kcnq4Q9JK97 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kcnq4Q9JK97 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kcnq4Q9JK97 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kcnq4Q9JK97 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kcnq4Q9JK97 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kcnq4Q9JK97 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kcnq4Q9JK97 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kcnq4Q9JK97 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kcnq4Q9JK97 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kcnq4Q9JK97 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kcnq4Q9JK97 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kcnq4Q9JK97 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kcnq4Q9JK97 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kcnq4Q9JK97 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kcnq4Q9JK97 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kcnq4Q9JK97 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kcnq4Q9JK97 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kcnq4Q9JK97 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Kcnq4Q9JK97 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kcnq4Q9JK97 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms